一键、批量通过9大miRNA-mRNA数据库预测miRNA的交集靶基因；输入基因，直接出结果出图！内附数据库源文件+万能代码下载

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之前我们给大家分享了R语言绘制50种SCI插图的视频教程（点击免费下载）。

也将输入文件和代码分享出来了（点击下载）。还给大家分享了单基因GSEA富集分析的代码（点击下载）。

今天我们要给大家分享一款：

“miRNA-mRNA互作一键批量预测工具”

输入miRNA或者mRNA，一键、批量通过9大数据库（“ENCORI","miRDB","miRWalk","RNA22","RNAInter","TargetMiner","TargetScan","NPInter","miRTarBase"）预测miRNA的mRNA和预测mRNA的miRNA。同时，筛选出交集靶基因。

比你只用一个数据库准确性高太多了。这个工具我们内部是用来发生信类的文章的（人种属），原价4599元。现在只要200元。

如果你也有了这个工具，那就轻松发纯生信类SCI（随便整一个疾病的miRNA数据集，用这9个数据库构建一下miRNA-mRNA网络，肯定就是一篇低分SCI。因为这9个数据库源文件+代码，是全网首发）。同时，我们做实验预测的时候也能够去除假阳性，轻松做实验。如下下载该工具：

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下面我给大家介绍一下如何使用。

首先，下载这份miRNA-mRNA互作一键预测工具后是这样的，有三份文件，分别是：R语言万能代码、输入文件和9大数据库文件（数据库源文件+万能代码，这一次我们是全部分享出来了哦）：

9大数据库文件是我们内部发生信类文章的，于是2022年3月中下旬从这9个数据库官网整理好的（非常新）：

具体每一个数据库格式如下：第一列是miRNA，第二列是mRNA：

接着，我以hsa-let-7a-2-3p和PDLIM5来一键批量预测给大家进行示范。

第一步：环境布置：

我们要把9大数据库文件、输入文件和函数代码放在一个非中文名的文件夹下：

第二步：整理输入文件：

输入文件格式如下：只有一列，这一列你可以放mRNA，也可以放miRNA。反正都是会去预测miRNA对应的mRNA，mRNA对应的miRNA。而且随便你放多少个，这里是批量进行预测的。

第三步：运行万能代码：

用Rstudio打开代码（自己百度下载R和Rstudio软件，都是免费的，下载默认安装就行了）：

这里运行代码的时候要注意，这一句代码一定要记得修改哦：

source("C:/Users/A/Desktop/2/data/.venn_P.R")#改成自己的目录

我这里data是在桌面的2文件夹下：

所以我的代码就是source("C:/Users/A/Desktop/2/data/.venn_P.R")。你自己放在哪个文件夹下，就按照这样的方式修改就行。

第四步：结果解读：

运行完之后，每一个miRNA/mRNA预测的靶标都会有一个文件夹：

文件夹内是其对应的靶标，如我打开hsa-let-7a-2-3p文件夹：

里面每一个数据库所预测的结果都是一个txt文档。这里也就是说hsa-let-7a-2-3p可以在miRDB、miRTarBase、miRWalk、NPInter、RNA22、RNAInter、TargetMiner这7个数据库中均有靶标，随便打开两个给大家看看：

同时重要的是，他们的靶标交集基因如下：

并且也有可视化的结果：7个数据库都能预测的交集靶基因有5个，分别是上面文件夹内的：ABI2、IGF1R、TP53INP1、FNDC3A、ARID1A。

然后我们用AI修图一下，就可以投稿啦：

嗯，这个工具就这么用，非常方便，比如我有几十个、几百个、几千个miRNA/mRNA，要预测他们对应的mRNA/miRNA。那只要替换我输入文件里面的名字：

然后点击代码运行：

随后就可以等待出结果啦：

轻松又简单。如下2022年这篇文章，miRNA-mRNA互作套路不管是做湿实验，还是生信预测。都是非常实用：

不说了。赶紧整起来，发纯生信SCI吧。

“miRNA-mRNA互作一键预测工具”

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辛苦整理，全文无任何广告！

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