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如何快准狠地找到相关领域的经典文献?

lingludi 生信宝典 2022-03-28

大多做科研的童鞋们大概都会遇到一个头疼的问题:怎么找文献?如何保证找到的文献都是相关领域的经典文献?之前我们有两篇推送:

本文教你如何根据H5指数查找相关领域的高精尖经典文献。

首先来了解一下什么是H指数、H5和H5中位数?

  • H指数(H-index):于2005年由美国加州大学学圣迭哥分校物理学家 Hirsch 教授提出,用于评价个人学术影响。Hirsch将该指数定义为:若某位科学家的Np篇论文中有h篇论文每一篇的引量都至少为h次,且其他(Np-h)篇论文中每篇的引量都<=h,那么这位科学家的H指数即为h。

  • H5指数:是指在过去整整5年中所发表文章的H指数;该指数打破了H指数不会随时间的推移而减少,只会增加或保持不变的情况。

  • H5中位数:是指出版物的H5指数所涵盖的所有文章获得的引用次数的中位值,即H5核内文献的被引频次的中位数。H5中位数指数不考虑 H核内的最低被引频次,而是考虑H核内所有文章的引用次数的中位值来评价期刊刊载的重大研究成果。(备注:H核内是该评价标准中的一个专有名词)

谷歌学术计量(GSM:Google Scholar Metrics)公布了包括英、汉、葡、德、西、法、韩、日、荷、意10种语言的期刊H5和H5中位数排名,可以进入链接(https://scholar.google.com/citations?view_op=top_venues&hl=en) 查看不同类型期刊的排名。

Nature排名第一,随后是NEJM和Science,Cell排名第六。Nature communication和NAR影响因子(你该知道的杂志分区和影响因子及2018最新影响因子下载)虽在10左右,H5 index排名都在前15。PloS ONE虽不被看好,排名也在25之内,引用量还是很大的。

点击数字,可以看到近5年文章的引用排名。

Nature的前10高引领域分布广,包括深度学习,太阳能电池,登革热、范德华力、癌症基因组突变和微生物组,确实都是比较火的领域。

新英格兰杂志,各种癌症和慢性病,3篇Melanoma,2篇肺癌,2篇中风,一篇PD-1,诺贝儿热门领域

Cell杂志高引文章次数低于Nature和NEJM,排名第一的是衰老,最多的是CRISPR-Cas9,中国人的名字比较多,张峰、王浩毅、Lei Qi。剩下的是3D Genome和超级增强子

也可以查看某一个子类,在此我们以生物信息学相关的期刊为例,依次点击Categories —— Engineering & Computer Science —— Bioinformatics & Computational Biology即可。

下面为谷歌学术计量统计的从2013-2017年生信期刊H5指数排名

Publicationh5-indexh5-median
Bioinformatics110188
PLOS Computational Biology79112
BMC Bioinformatics6186
Briefings in Bioinformatics5681
Database: The Journal of Biological Databases & Curation4363
Journal of Theoretical Biology4269
BMC Systems Biology3750
GigaScience3644
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics3244
Genomics, Proteomics & Bioinformatics2948
Journal of Mathematical Biology2940
Mathematical Biosciences2836
Journal of Biomedical Semantics2634
Journal of Computational Biology2337
International Conference on Research in Computational Molecular Biology2137
Mathematical biosciences and engineering: MBE2027
Algorithms for Molecular Biology1926
Pacific Symposium on Biocomputing1926
Computational Biology and Chemistry1924
Genomics & Informatics1830

还可以点击各期刊的H5指数链接,查看构成某个期刊H5指数的核心文章。

排第一的是做系统进化分析的RAxML, 第二的是Illumina测序质量过滤工具Trimmomatic (高通量测序的发展功不可没),第三和四的STARHTseq常用于处理转录组数据的比对和定量 (实际上STAR自带HTSeq的功能,易生信 - 转录组专题分析第4期开课啦)。

这样,你便轻松找到了感兴趣领域里的高引量文献,慢慢享用吧~

可能有人会质疑了,根据H5指数查找是否靠谱?

不要担心,有学者专门做过统计,发现H5指数和H5中位数与传统意义上的期刊评价指数(IF、IF5、ES和AIS)均成极显著正相关,且相关系数大都在0.9以上,表明H5指数和H5中位数在对期刊的评价中有较大的优势。

但同时这样的评价标准也是存在一些问题的,如不能查看谷歌的H5指数往年数据,因此不能进行横向比较;H5指数对于新创刊的期刊或新发文章没有时间优势,可能没办法及时追踪到最新的前沿等。

而跟进科研动态的途径有很多,比如1)设置学术期刊或出版公司的电子邮件提醒;2)关注感兴趣作者的社交账号;3)加入科学界的Facebook——Researchgate,里面有很多业内大咖,还有可能与世界同行进行交流;4)定期访问文章官网,查看文章最新动态;5)关注相关专业的论坛和网站等等,但这需要你勤快一点,多多浏览。

找到想要的文献之后,就是如何获取全文了。Sci-Hub是一个提供大量自动且免费的付费学术论文的网站(https://lovescihub.wordpress.com/) ,于2011年由哈萨克斯坦研究生亚历珊卓·艾尔巴金创立,在Pubmed上输入文献名字,获取文章DOI号后,在上述网址中输入文献DOI号即可下载。

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