NBT(IF=68) | 刘如谦团队开发新的小型、高效的胞嘧啶碱基编辑器
iNature
碱基编辑器由融合到脱氨酶上的可编程DNA结合蛋白组成,可以在目标基因组位点上实现精确的核苷酸改变,而不需要双链断裂。目前的CBE可将C•G碱基对转化为T•A,由胞苷脱氨酶融合到Cas9镍酶或TALE重复序列和尿嘧啶糖基化酶抑制剂(uracil glycosylase inhibitor, UGI)域组成。
2022年11月10日,哈佛大学/Broad研究所刘如谦(David R. Liu)实验室在Nature Biotechnology杂志在线发表题为“Evolution of an adenine base editor into a small, efficient cytosine base editor with low off-target activity ”的论文,该研究进化了高活性脱氧腺苷脱氨酶TadA-8e,通过噬菌体辅助的连续进化来进行胞苷脱胺。进化出的TadA胞苷脱氨酶包含DNA结合残基的突变,改变了酶的选择性,使其强烈倾向于脱氧胞苷而不是脱氧腺苷脱氨。与常用的CBE相比,TadA衍生的胞嘧啶碱基编辑器(TadA-derived cytosine base editors, TadCBEs)具有类似或更高的靶上活性、更小的体积和更低的Cas独立的DNA和RNA脱靶编辑活性。
此外,还发现了一个TadA双碱基编辑器(TadA dual base editor, TadDE),它可以进行同样高效的胞嘧啶和腺嘌呤碱基编辑。TadCBEs支持原代人T细胞和原代人造血干细胞和祖细胞中与治疗相关的基因组位点上的单或多碱基编辑。TadCBEs扩展了CBE在精确基因编辑方面的用途。
E.N.D
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