闫雪珊《再创·周刊》栏目负责人，科普工作者。中国科学院上海分院博士在读，主要研究方向为基因组工程。孟凡康再创创始人。帝国理工学院博士在读。希望能够将生物技术应用于人类太空探索。🚀🚀🚀🌟🌟🌟\

认为，人们可能被最新技术所吸引，而忽视了它是否真正有助于实现最终目标。他说：“你可能会浪费大量时间让机器执行你想要的任务，但最终可能无法得出可行的答案。我们正试图避免这种情况。”并非所有人都在紧跟

的合作。该合作专注在高性能工业微生物菌株的设计，旨在实现目标蛋白质的快速生产与成本效益。大概两年前，

合作以加快我们的进展是合理的。凭借他们庞大的菌种代码库和路径专业知识，可以缩短菌种工程周期，以及他们可扩展的代工能力，我们相信我们可以努力将我们的工艺提升到新的水平。"Visolis

40」合成生物新锐企业评选：为了更新大家对中国合成生物学产业图景的理解，找出其中极具代表性和成长势能的企业，也希望这些企业可以继续以理性客观的态度来面对发展中的机会和困难，在本次会议上，EB

乙醇，从工业排放物中捕获碳，并将其转化为乙醇，以用于高级香水的制作。"工业活动产生的废气通常最终成为碳排放物，例如在钢铁制造过程中产生的一氧化碳和二氧化碳（

根据澳大利亚战略政策研究所（ASPI）的一份报告显示，中国在大多数关键和新兴技术领域的高影响力研究中确立了显著的领先地位，正在主导全球未来的技术竞争。这份名为《关键技术追踪》的报告研究了44项关键技术，涉及国防、太空、机器人、能源、生物技术、人工智能、先进材料和关键量子技术领域。//报告解读中国的全球领先优势扩展到44项被追踪技术中的37项。《关键技术追踪》报告显示，在某些技术方面，世界排名前

为进一步加强国内外合成生物学领域的交流合作，提高我国在合成生物学领域的国际地位，推动国内生物产业蓬勃发展，4月27至28日，第四届工程生物创新大会、第二届中国合成生物学学术年会、首届亚洲合成生物创新大会（以下简称“大会”）将在深圳光明科学城启幕。大会汇聚国内外政、产、学、研、资各方嘉宾，以及来自日、韩、新加坡的亚洲合成生物学代表，构建高标准、高质量合成生物学国际交流平台，聚焦合成生物技术创新、产业转化、资本应用等热点话题，引领生物制造新革命，打造生物经济新引擎。大会深度融合合成生物创新链、产业链、资金链、人才链，旨在构建合成生物产业集聚生态，助力生物经济跨越式发展。大会上，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所、深圳合成生物学创新研究院、深圳理工大学（筹）合成生物学院将联合发布2023深圳合成生物十大新品，为生物制造多个应用领域带来新的技术变革与产业升级；“EBInsights（工程生物产业数据分析平台）”造物40合成生物新锐企业榜单2023将正式发布，为合成生物产业绘制新蓝图；合成生物产业创新联盟揭牌暨资本子联盟签约仪式将举办，为合成生物产业集群和生态建设加速；“SynStar300（合成生物星链300）”计划将正式启动，进一步加速产业集群和生态建设，打造“基础研究+技术攻关+成果产业化+科技金融+人才支撑”全过程创新生态链。。大会还设置工程生物“大家”说、合成生物高端圆桌论坛、合成生物国际论坛等环节以及凸显合成生物时代下新兴力量的项目路演，探究合成生物学的方方面面，带来一场透视生物制造、生物经济未来发展的思想盛宴。本次大会由深圳市人民政府指导，深圳市发展和改革委员会、深圳市科技创新委员会、深圳市光明区人民政府、中国生物工程学会合成生物学分会、ANSO“一带一路”国际科学组织联盟、深圳理工大学（筹）、中国科学院深圳先进技术研究院、亚洲合成生物学协会联合主办。（来源：央视网

分裂蛋白质对系统（LASL）。生物活性蛋白可以在短暂（通常为几分钟）暴露于特定光源后从非功能性分裂片段稳定地组装成对，以通过完全时空控制的、快速且不可逆地激活蛋白质功能[9]。

的新计划，以帮助该国在提供安全食品供应方面引领世界。在来自巴斯大学、伯明翰大学等专家的领导下，细胞农业制造中心将用于大规模生产培植肉[12]。来源：Vegconomist#Ginkgo

Teacher）将能够注册为导师（Supervisor）。导师的注册需要额外提供以下信息：实验室或者办公室地址、电话联系方式、实验室或者个人网站地址。团队信息注册只有导师（Primary

4.0」与生物技术的跨界交融正以一种浪漫的方式，让「智能生长」成为可能。生物技术企业的研发转型机遇似乎就在眼前，然而这也意味着对传统生物研发模式的颠覆性革新，未知与挑战重重。「工业

Quorn，以及国内的利用生物质发酵和精密发酵开发食用蛋白以的蓝佳生物等。除了生产高营养价值的食品外，合成生物学还可以用来减少食品生产中的碳排放。已如上述，与生产动物来源的肉相比，生产人造肉能减少

日签署的《关于推进生物技术和生物制造创新以实现可持续、安全和可靠的美国生物经济的行政命令》，旨在降低物品价格、创造良好的就业机会、加强供应链、改善国民健康并减少碳排放。

关注再创（Bio-regenesis），后台回复：周刊24，获取本期周刊所有「学术界」的文章原文。

Bioworks宣布SPAC上市后不到两周，宣布Biogen与建立合作伙伴关系。据BioSpace报道，两家公司“旨在重新定义制造重组腺相关病毒（AAV）载体的行业标准”。

Arnold进化，生命系统最独特、最神奇、最有力量的工具、武器以及能力。过去十年，最受关注的进化事件莫过于更多进化的工具如PACE的诞生[26]、诺贝尔奖花落定向进化开创者：Frances

Keasling以及赵国屏院士等知名专家学者进行了主旨演讲，Keasling院士的演讲题为“Engineered

曲线，是讲DNA合成和测序价格随着时间下降的变化曲线。但我觉得DNA

对于这项技术的应用前景，文章通讯作者，爱丁堡大学王宝俊博士说到：“这项技术有潜力发展成为对细菌细胞进行“基因编程”的有力工具，在研究领域与生产实践中都有广泛的应用前景。”参考文献1.

数据显示，二氧化碳在大气中仅占大约百万分之405，甲烷则只占百万分之二。尽管大气中温室气体浓度较低，但自养生物—如漂浮在世界海洋中的大片蓝藻—可以利用阳光有效地将二氧化碳转化为食物和氧气。

中国科学院大学预计阅读时间：8min关注本微信公众号，回复：“路线图”，获得文章中提到的EBRC工程生物学发展路线图报告PDF文件！1

可预测性-“生物学有令人难以置信的不可预测性”：目前无法确保有机体能够按初始设计的要求和预测结果进行输出。半导体产业和合成生物学产业都涉及一系列设计工具以及将原材料转化为先进的设备和系统的各种流程。

5)。串联的强终止子可以被插入基因的周围，以确保单个操纵子的独立表达。最近独立于Rho的终止子库已经被建立和表征，以保证大型基因线路在通读和同源重组方面的鲁棒性。模式五：元件连接序列干扰Figure

interference)CRISPR系统用Cas核酸酶和引导RNA在特定的DNA序列中引入双链断裂，而不具有核酸酶活性的突变Cas蛋白(如dCas9和Cas9N-)可以用作转录因子，通过形成DNA

生物学领域从来不缺乏想象力，而是缺乏实现的方法。在生物学领域，通常情况下应用和研究的边界是被各种因素限制的。最常见的限制就是工具的缺乏。

Liu、张浩千以及夜神K2三位答主的精彩回答，详情请点击：合成生物学需要坚持工程学理念吗？（上）。今天我们将郭昊天博士的精彩回答整理于此，欢迎各位进行讨论！4知乎答主：郭昊天巴黎第五（笛卡尔）大学

的例子呢，就好比随机蛋白序列产生抗菌肽活性、抗T2D或者减重的mRNA药物研发，或者堆随机序列检测promoter活性的工作。非常粗放但不乏有惊艳的产出。#3

在紧张的实验生活之外，我也在不断的询问自己：如何让自己的思考更加具有深度和广度？我想这个方面除了自己的广泛阅读和精读之外，似乎还缺了一个重要的环节：一个让人感兴趣的问题。合成生物学涉及的方面太多，泛泛的阅读和讨论往往让人的思考流于表面，但是一个很好的问题却可以让人慢慢品味和深度思考。

在紧张的实验生活之外，我也在不断的询问自己：如何让自己的思考更加具有深度和广度？我想这个方面除了自己的广泛阅读和精读之外，似乎还缺了一个重要的环节：一个让人感兴趣的问题。合成生物学涉及的方面太多，泛泛的阅读和讨论往往让人的思考流于表面，但是一个很好的问题却可以让人慢慢品味和深度思考。

Prize。从这一结果中也不难看出，不出预料地，高中iGEM在中国地区正在迅猛发展，各类高质量商业服务的介入让高中iGEM未来还有在中国持续升温的空间。2018年iGEM竞赛已经落下帷幕，iGEM

Monod发表了一篇具有里程碑意义的论文，文中描述了大肠杆菌中感应和消耗乳糖的遗传电路。他们关于代谢基因是如何被调控（后人广泛知晓的lac操纵子）的描述正是此类领域的开山之作。lac操纵子遗传电路。

Portal等存储库中的大量基因型数据，为利用机器学习生成综合网络模型带来了所需要的原始生物材料。从机器学习的角度出发，思考如何将这些网络模型与生化上可获得的丰富信息结合起来是及其令人激动的。

另一方面，监督方法适用于输入数据数据包含有标签的情况。在这种情况下，标签用于训练机器学习模型，最终给出模式。受监督的方法通常与机器学习的应用相关联，因为训练的模型是预测性的;

这是一个关于合成生物学未来的视频。在近些年来，合成生物学技术出现了革命性的发展。这使得我们可以按照自己的设计以廉价并且精准的方式改造生命。通过将有机和无机相互结合，我们可以创造新的生命形式。

给小鼠喂食细菌72小时后，研究人员就发现拟杆菌已将自己携带的改造基因传递给了小鼠肠道中的其他微生物——并且这些拟杆菌还获得了其他的一些基因，能够帮助它们不依赖外界提供胸苷而存活。

【编辑注】：本周再创丨Regenesis正式开启了“喜欢作者”功能，如果您觉得本文的文章写得不错，可以在文末对作者进行赞赏哦，具体信息请戳：再创丨关于启用“再创”之名统一进行公众号文章原创标注、赞赏、宣传等活动的公告作者：李辉简介：中国科学院大学，青岛生物能源与过程研究所在读硕士，研究方向为蓝细菌CRISPR系统的表征以及新型遗传学技术的开发，研究兴趣还包括微生物代谢工程以及合成生物学。本科毕业于西北农林科技大学，研究兴趣为木质纤维素的定向降解以及单糖的转化。编辑：孟凡康

尊敬的各位“再创丨Regenesis”的作者以及读者：近期微信公众号公布了关于“赞赏功能”的新规定，其中以后可以通过“喜欢作者”对文章进行一定数额的赞赏，以鼓励作者进行更多原创且优质的内容。其中规定，统一作者名发表发表3篇以上的原创文章，可以邀请创建一个赞赏账号。公众号平台关于赞赏功能的介绍为了鼓励再创公众号的作者可以更好的创造优质的文章内容，且为了统一赞赏资金的管理，在以后的原创文章中，我们将会统一启动“再创”两字代表“再创丨Regenesis”公众号申请文章原创内容，同时对于作者的信息我们将会在文章中更加清晰醒目的位置对作者进行更加详尽的介绍。同时对于赞赏金额的管理，我们初步的规划如下：对于赞赏所得的金额，我们将按照两部分进行分成：一部分为作者所得，一部分是编辑部所得。我们的阈值设定为20元。如果赞赏金额没有超过20元，则所有金额归作者所有；如果赞赏金额超过20元，那么超过20元的部分，我们将按照3:7的比例进行分成，其中的30%将给予编辑部用于活动基金或者给予做出贡献的编辑(审稿、排版等)。“再创”的名字源于George

2003)，这给临床治疗增加了很大的潜在风险。所以，对于兼性厌氧菌的合成生物学改造成为必然，香港大学黄建东教授研究团队通过基因工程重组技术和合成生物学的理念成功将沙门氏菌改造为专性厌氧菌YB1(Yu

T设计包含一个scFV（抗体单链可变结构）和细胞内信号结构域（CD3z和共刺激结构域）。但这种固定化设计使得我们每次都需要重新改造T细胞才能使其实现新的功能，同时这也使得我们难以控制CAR

编者的话·写在前面毋庸置疑，生命过程是一个极其复杂的动力学过程。从宏观上自然界中的物种更替，深入到微观中的分子涨落，都展现出有趣而复杂的动态行为，各种动态网络相互影响，相互呼应，交织而成宏大的生命乐章。动力学过程的复杂性源于其非线性的性质，在这一前提下，我们很难对于系统内所有的动态过程进行完整无偏的定量描述与预测，只能局限于对系统的定性刻画与分析。难得的是，生命系统作为一个能够自维持的非平衡定态系统，应对环境的各种扰动以保证自身的稳定生长是其必需的性质，这使得我们有机会在可接受的程度上对系统进行简化，获得相对稳定的观测结果，最终在所关注的层次上建立理论模型，解读并预测系统演化的过去与未来。

be.在模式微生物中，合成生物学正在成长为一门成熟的工程学科，但是对于大多数真核生物来说，这一目标还很遥远。在这篇文章中，Francesca

al.曾利用转录和转录后iFFLs部分解耦了基因表达水平和转化进哺乳细胞的DNA量的关系。相似的设计也表明iFFLs可以减少由生长差异导致的基因表达水平的变化。在发表在《Nature

rRNA经过合成和加工后构成正交核糖体，再启动GFP的翻译。如此，研究人员就构建出了一个单用细胞内源元件无法完成的FFL。值得一提的是，通过更换正交核糖体部分的基因表达结构，研究人员可以实现诱导T7

https://www.eurekalert.org/pub_releases/2018-01/wios-bis012518.php2.

癌症免疫疗法基于RNA的免疫调控基因电路一千个读者就有一千个哈姆雷特，同样的一千个科研工作者就有一千个合成生物学。一些科研工作者试图重走生命进化之路，他们先是合成原核生物支原体，接着合成真核生物酵母，雄心勃勃的他们现在更是想合成更加复杂的人类细胞；另一些科研工作者试图给生命体注入新的人造碱基、人造氨基酸、人造能量系统等；还有一些人试图通过改造现存生命来解决人类所面临的环境、能源、材料、健康等方面的问题，本文介绍的就是这个方向下合成生物学用于癌症治疗的一个研究。READ

当谈到“唱片”时你能想到什么？当谈到“DJ”时你又能想到什么？是这样？还是这样？如果你的想象力还停留在上面的两张图，那么接下来可能会颠覆你的认知。2017年11月的波士顿，在合成生物学领域的“奥林匹克盛会”国际遗传工程机器大赛（iGEM）闭幕式上，我们听到了一曲五大洲参赛队伍共同创作的一首“天籁之音”。但这首音乐不是通过打击乐器或者弦乐器创作的，创作者竟然是来自人体的细菌！是的，你没有听错，这不是天方夜谭，“艺术细菌”真的存在，并且这些“艺术细菌”为我们创造了一首独特的音乐。对于我们大多数人来说，细菌和音乐是两个完全不相关的概念。但是这支名为Biota

编者的话·写在前面前言：概括地讲，当前合成生物学的发展有三大主流方向：首先是以基因组合成为主要手段的合成生命体研究，代表性工作如最小基因组、人工染色体等；之二是利用对工程菌物质能量代谢的改造，实现高附加值生物产品的工业级发酵，可理解为生物合成，是合成生物学有极大应用潜力的方向。第三个方面是从理解生命现象的角度出发的：研究存在的生物互作网络具有较高的难度和约束，若能利用已有的生物学基础，自主构建出由生物“节点”的相互作用“连线”组成的生物网络，这样就很大程度上将问题简单化；更进一步，生命系统是动力系统的一种，如果将生物分子的互作加以抽象，并用数学的语言书写，就能够利用计算机工具模拟研究生物分子的量（浓度）随时间（或空间）的变演情况，发现更深层次的普适性规律，进而回过头来指导对于生物系统的设计和改造。于是，与系统生物学“自上而下”地理解生命相互补，合成生物学走出了一条“自下而上”从头搭建生物网络的研究范式，并且很自然的，人类在工业化进程中发展出的动力学控制理论由此介入生物的理性设计之中。事实上，在公认的合成生物学“开山之作”[注]的两篇论文中，都能够看到动力学理论在设计中的重要分量。那么今天，我们“再创丨Regenesis”团队便以一篇论文为例，为大家简述如何实现利用动力学理论进行对生命系统网络的剖析和生命系统再设计的指导。在这里，我们将更多地关注研究思路，不涉及过多的数理细节；此外，由于编辑团队多为生物背景，而原文涉及大量的理论内容，因此难免会存在理解的浅薄乃至不当，若读者有所查察，还望批评指正。作者：孙智校对：邓婷月

最近，新的基因编辑工具——DNA单碱基编辑成为人们关注的热点，这项技术有望在单碱基编辑上比目前CRISPR-Cas9编辑模式实现更高的编辑效率，并且安全性更高。这方面的工作主要由哈佛大学的David

的缺乏3’->5’外切酶活性的DNA聚合酶，引入增强持续合成能力结构域从而提高速度和保真度的DNA聚合酶，具有泛底物特异性允许掺入修饰碱基（例如带有荧光标记的dNTP）的DNA聚合酶，等等。