联川生物R语言培训班（郑州站）招生啦~

联川生物特邀经验丰富的讲师团队，为大家带来为期5天的R语言培训班 通过5天的系统学习，进行大量的案例操作，让您一次性彻底掌握R语言的使用。

课程特色： 

1. 小班授课，招收30名学员，方便指导每个学员；
2. 五天时间，包含R语言基本介绍，扩展包安装，数据转换，R语言绘图，利用R分析RNAseq数据，WGCNA分析，TCGA分析等内容；

3. 准备大量案例，通过远程访问Rstudio与本地端运行，能够顺利运行每个案例；
4. 以完整项目为案例，通过亲自上手操作，快速掌握技能，五天完成1万行代码；
5. 赠送32G优盘，含有大量生物信息学习资料，可继续巩固学习；
6. 赠送100页以上纸质版讲义一份。

培训信息

特邀讲师团队：基因学苑王通老师

培训时间：2019年9月7-11日，9:00-17:30

培训地点：郑州(具体地址报名后告知)

主讲老师：王通

曾任职于华大基因，9年以上生物信息分析经验，擅长基因组，转录组，宏基因组，肿瘤基因组等数据分析。

2015年开始创业，主要做生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者，已制作视频500集以上。

首创视频＋云服务器培训模式，目前已在北京，深圳，哈尔滨，杭州，武汉，南京，长春，广州，青岛等组织过多场培训班，线上线下累计学员超过4000多名。公众号“基因学苑”作者，已写作生物信息教程150多篇。

日期	主题	课程安排
第1天 （上午）	R语言基础与文件操作	一 R语言基础 1.1 R语言简介 1.2 R软件安装 1.3 Rstudio软件安装和使用 1.3 Rstudio 设置 1.4 设置工作目录 1.5 R函数 1.6 安装R包 1.7 Bioconductor介绍 1.8 获取帮助 1.9 R语言个性化设置 1.10常用快捷键 1.11 常见错误
第1天 （下午）	R语言数据结构	二 文件操作 2.1 手动输入数据 2.2 读入文件 2.4 写入文件 2.5 读写excel文件 2.6 访问数据库 三 R语言数据结构 3.1 内置数据集 3.2 向量 3.3 矩阵 3.4 列表 3.5 数据框 3.6 因子 3.7 缺失数据 3.8 时间序列
第2天 （上午）	数据索引与操作	四 数据索引及操作（重点） 4.1 数据索引 4.2 筛选过滤 4.3 排序sort与order 4.4 分组统计 4.5 数据合并与拆分 4.6 tidyr与dplyr
第2天 （下午）	统计检验与数据挖掘	五 统计检验 5.1 零假设检验 5.2 频数统计与独立性检验 5.3 t检验与wilcox检验 5.4相关性检验 六 R语言数据挖掘 6.1线性回归 6.2基因组大小与基因个数线性回归 6.3购物篮分析 6.4用户收听习惯分析， 6.5 利用机器学习预测乳腺癌
第3天 （上午）	R语言绘图	七 R语言与生物信息绘图 7.1 R语言绘图系统介绍 7.2 高级绘图与低级绘图 7.3 绘图参数 7.4 绘图函数包 7.5分组条形图
第3天 （下午）	R语言绘图	7.6基因长度分布直方图 7.7饼图及扇形图 7.8箱线图 7.9热图 7.10韦恩图 7.11 gwas分析曼哈顿图 7.12 COG功能注释图 7.13 ggplot2绘图系统
第4天 （上午）	RNAseq分析	八 R语言分析RNAseq数据 8.1 RNAseq简介 8.2 RNAseq基本分析流程 8.3几种RNAseq定量方法比较 8.4下载参考序列及GTF文件 8.5分析案例介绍 8.6 hisat2比对与reads计数 8.7 利用R分析RNAseq 8.8差异表达基因筛选 8.9 结果可视化
第4天 （下午）	基因功能注释	九 基因功能注释以及富集分析 9.1 注释相关包介绍 9.2基因ID转换 9.3 GO功能注释与富集 9.4 GO功能注释可视化 9.5 KEGG功能注释与富集 9.6 KEGG功能注释可视化 9.7利用AnnotationForge创建注释包
第5天 （上午）	WGCNA	十加权共表达网络（WGCNA）分析 10.1 WGCNA介绍： 10.2 WGCNA应用案例： 10.3实验设计 10.4输入数据格式 10.5 寻找最佳beta值 10.6 构建共表达网络 10.7 模块与表型相关性计算 10.8 Cytoscape可视化
第5天 （下午）	TCGA	十一 TCGA数据挖掘 11.1 TCGA简介 11.2 TCGA实验设计 11.3 TCGA数据下载 11.4 TCGA数据合并与转换 11.5 TCGA分析案例 11.6 生存分析 附录一: R语言常用包 附录二：R语言参考卡片 附录三：R内置数据集

报名方式：

1. 微信公众号报名：关注联川公众号，对话框回复：培训+姓名+单位+电话；

2. 邮件报名[e-mail]：邮件主题“培训报名”，正文：姓名+单位+电话；

3. 委托联川驻各地科技代表报名 

4. 联系谢  飞：15038330988（微信同），直接报名预约；

           张兴瑞：15838026651  (微信同），直接报名预约；

收费标准：

培训费：5000元/人

注意事项：

• 请在培训开始前全额支付培训费。由于名额有限，过期未缴费者，名额将无法保留哦
  

• 支付方式：对公转账，账号信息如下，

       账户：杭州联川生物技术股份有限公司

       账号：383158327308

       开户行：中国银行杭州经济技术开发区支行

      注意：汇款单上请备注您的姓名，以便核对。

• 发票开票内容：技术服务培训费、生信技术服务培训费、miRNA技术服务培训费，测序分析费等。

• 其他：可提供培训通知、会议通知、合同等。

常见问题：

1. 为什么要学习R语言？

R语言是一款统计软件，随着生物大数据的大量产出，越来越需要统计软件进行数学统计与检验，以及数据挖掘，而这些工作都可以通过R原因来完成。

2. 想学习python进行数据分析，还需要学习R语言吗？

R语言包含了bioconductor项目，可以完成大量生物信息分析项目，这个是目前python没有的，而且学习python与R并不是互斥的，而是相互促进的。

3. 需要绘制一些图形，这个课程可以达到吗？

其实绘图只是R语言一部分功能，但熟悉R语言的数据结构之后，利用R语言绘图并不难，通过本次课程，可以学会各种数据的可视化。

4. 需要做哪些准备，对电脑系统有要求吗？

对计算机系统没太多要求，流畅运行即可，上课为了节省时间，我们都是通过远程登录服务器的方式使用R语言，这些案例可以课后在个人电脑上运行。

5. 培训完后面有不会的问题怎么办？

培训班结束了，学习并没有，我们有培训交流群，后续可以在群内继续交流学习。

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