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成人耳念珠菌感染诊治防控专家共识

指南共识专辑 离床医学 2023-11-22

成人耳念珠菌感染诊治防控专家共识

引用:宁永忠.成人耳念珠菌感染诊治防控专家共识[J].临床检验杂志,2020,38(08):564-570.


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近年来,耳念珠菌(Candida auris)和耳念珠菌感染成为国内、国际(https://www.cdc.gov/fungal/candida-auris/)关注的热点。

该菌检测困难,容易漏检;大部分多重耐药,甚至泛耐药(pan-resistant),治疗困难;其引起院内感染暴发的报道不断增加,亟需加强感染防控与监测。

中华医学会检验分会临床微生物学学组组织专家对该菌的病原学、流行病学、鉴定、抗真菌药物敏感性试验、同源性研究技术、诊断、处置、预防和控制等内容,进行阐述和推荐。

病原学


第一株耳念珠菌分离自外耳道感染。

auris,拉丁语含义为耳朵。

耳念珠菌属于棒孢酵母属的念珠菌分支(CTG clade),该分支菌种的重要特点是开放阅读框中CTG三联体密码子通常编码丝氨酸,而不是传统的亮氨酸。

念珠菌分支的代表性临床致病菌种多达16余种,包括白念珠菌和热带念珠菌、都柏林念珠菌、近平滑念珠菌、克柔念珠菌、耳念珠菌等非白念珠菌物种。

耳念珠菌与希木龙念珠菌和葡萄牙念珠菌的进化关系比较密切,但与临床常见念珠菌如白念珠菌、热带念珠菌和近平滑念珠菌相对较远。



该菌地理分布广泛,有千个以上的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)差异,相应表型特征、毒力、耐药性等均不同。

基因组分析提示耳念珠菌存在5个不同的进化支:

南亚(印度/马来西亚/科威特/巴基斯坦)分支、

南非分支、

南美洲(委内瑞拉)分支、

东亚(日本/韩国)分支

和伊朗分支。

进化支间的变异和进化支内的同源性分析表明,相似度高的菌株可在多个地理区域独立出现。


该菌常呈多重耐药,一些菌株(型)对现有的3类抗真菌药均耐药。

该菌对氟康唑、两性霉素B或两者同时具有内源性或诱导型耐药。

美国2019年抗生素耐药威胁报告中将病原微生物威胁分为4个等级,即紧迫威胁(urgent threats)、严重威胁(serious threats)、需关注的威胁(concerning threats)和监视清单(watch list),其中将耳念珠菌列为紧迫威胁。

一些常用的消毒剂不能杀灭该菌。

流行病学


日本于2009年最先报道耳念珠菌,患者是东京一名70岁女性。

国际抗真菌监测计划(SENTRY)中一组罕见念珠菌的调查显示,2009年之前耳念珠菌的分离极少,2004—2015年4大洲复核的15 271株分离株中,只有4株为耳念珠菌。

美国于2015年报道该菌,引起关注。

回顾性复核发现1996年韩国已分离出耳念珠菌临床菌株。

与2015—2017年平均值相比,美国2018年临床病例数共有323例,增长了318%。

中国内地最先由北京大学王辉教授团队于2018年报道该菌。

目前中国内地(大陆)、台湾和香港地区公开报道的耳念珠菌感染病例报道数量已达25例。



概括而言,该菌可引起重度感染,多重耐药时导致治疗困难,容易播散,可以引起暴发。

微生物学鉴定


3.1 疑似耳念珠菌的提示


遗传分析显示,该菌与葡萄牙念珠菌、希木龙念珠菌等关系较为密切。


推荐1:

以下情形须考虑耳念珠菌的可能性。

(1)念珠菌在25℃不形成假菌丝,42~45℃能够生长;

(2) Vitek YST:鉴定为希木龙念珠菌、葡萄牙念珠菌、C.duobuhaemulonii、无名念珠菌;

(3) API 20 CAUX:鉴定为胶红酵母(Rhodotorula glutinis)(但没有特征性红色素)、清酒念珠菌(C.sake)或鉴定结果不确定(unidentified);

(4) API Candida:鉴定为无名念珠菌;

(5) BD凤凰念珠菌鉴定卡:鉴定为希木龙念珠菌、链状念珠菌;

(6) Micro Scan:鉴定为白念珠菌、热带念珠菌、近平滑念珠菌、无名念珠菌、葡萄牙念珠菌、季也蒙念珠菌;

(7) Rap ID Yeast Plus:鉴定为近平滑念珠菌;

(8)生物梅里埃质谱:鉴定为白念珠菌、希木龙念珠菌或鉴定结果不确定;

(9)念珠菌对唑类多重耐药或对两性霉素B耐药。文献报道,93%的耳念珠菌临床分离株对氟康唑耐药,33%对伏立康唑耐药,35%对两性霉素B耐药。


3.2 分离鉴定技术


该菌镜下形态学无特征性提示,需要菌落分纯后进行菌种鉴定。

正确鉴定要求人员意识到位、经验充足、质控在控,结果有可信性、重复性、可比性。


3.2.1 传统方法


推荐2:

Vitek 2 YST 8.01版本可以鉴定耳念珠菌;该版本鉴定的希木龙念珠菌、C.duobuhaemulonii,需要进一步判断是否耳念珠菌。

而BD凤凰念珠菌鉴定卡、Micro Scan、生物梅里埃API 20C、Rap ID Yeast Plus不能鉴定该菌。


推荐3:

显色培养基可做初步鉴定,但不能最终鉴定。

耳念珠菌在沙保弱琼脂培养基上菌落为白色或奶油色,在CHROMagar平板上为粉色或米黄色,培养第4天可变为淡粉红色或紫色。

念珠菌显色琼脂CHROMagar Candida或Chroma ID Candida可以初步区分希木龙念珠菌与耳念珠菌。

耳念珠菌在24 h内可长出更大的菌落,并且在24~48 h内菌落颜色从无色变为粉红色或米色。

该菌42℃生长良好(而希木龙念珠菌不能在42℃生长),加0.01%放线菌酮不生长。因为颜色多样、无特征性,所以显色培养基无法做最终鉴定。


3.2.2 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assistedlaser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)


推荐4:

布鲁克质谱仪,MALDI Biotyper CA system(版本4)或Bruker RUO数据库(2014[5627]及以上版本数据库)可以鉴定该菌。

Bitoyper RUO数据库鉴定耳念珠菌准确率为75.4%~100%。

样本处理推荐乙醇/甲酸提取法。


推荐5:

生物梅里埃质谱仪,MS IVD 3.2版本(IVD)(该版本的数据库目前尚未获得美国食品药品监督管理局认可)或MS Saramis 4.14及以上版本(RUO)可以鉴定该菌。

生物梅里埃质谱仪Vitek MS的IVD 3.2版本鉴定耳念珠菌的准确率为96.7%,RUO数据库鉴定耳念珠菌的准确率为93.4%。

样本处理推荐直涂法。


3.2.3 分子生物学方法


推荐6:

用26S r DNA D1/D2区域或内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列作为菌种鉴定的目标,引物序列如下。

ITS上游引物:5'-GTCGTAACAAGGTTAA CCTGCGG-3',下游引物:5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3';26S r DNA D1/D2区上游引物:5'-GCATATCAATAAGCGGAG GAAAAG-3',下游引物:5'-GGTCCGTGTTTCAAGACGG-3'。

基于上述引物进行PCR扩增和测序,结果须可重复、可验证、可比较。

和Gen Bank数据库中耳念珠菌南亚、东亚、南非、南美或伊朗分支中任一分支的基因序列相比,序列比较一致性超过98%,认为是同一个菌种。


推荐7:

与耳念珠菌表型相近的希木龙念珠菌、葡萄牙念珠菌、Candida duobushaemulonii鉴别时,可考虑采用实时PCR(real-time PCR)方法。

耳念珠菌特异性引物:F:5'-C GCACATTGCGCCTTGGGGTA-3';R:5'-GTAGTCCTACCTGATT TGAGGCGAC-3'。

耳念珠菌及相关种属(耳念珠菌、希木龙念珠菌、葡萄牙念珠菌、Candida duobushaemulonii)特异性上游引物:5'-GCGATACGTAGTATGACTTGCAGACG-3';下游引物:5'-CAGCGGGTAGTCCTACCTGA-3'。


理由:

Kordalewska等用此体系对140株临床分离真菌菌株(含44株耳念珠菌、7株希木龙念珠菌、6株葡萄牙念珠菌、6株Candida duobushaemulonii、73株其他酵母样真菌和4株丝状真菌)进行鉴别,其结果与基于r DNA的测序结果100%一致。


3.3 原始标本的分子生物学检测


推荐8:

以耳念珠菌ITS2基因为靶标,用实时荧光PCR(Taq Man探针法)检测临床样本中的耳念珠菌,引物及探针序列如下。

ITS2基因特异性引物F:5'-CAGACGTGAAT CATCGAATCT-3',R:5'-TTTCGTGCAAGCTGTAATTT-3',探针P:5'-FAM-AATCTTCGC-ZEN-GGTGGCGTTGCATTCA-IFQ-3'。

bicoid基因特异性引物F:5'-CAGCTTGCAGACTCTTAG-3',R:5'-GAATGACTCGCTGTAGTG-3',探针P:5'-Quas570-AACGCT TTGACTCCGTCACCCA-IRQ-3'。


理由:

Leach等利用实时荧光PCR检测临床样本的敏感性介于89%~100%,Ahmad等进一步用247例确诊病人皮肤样本进行评价,证实该方法具有良好的诊断性能(敏感性93.6%,特异性97.2%)。

美国疾病控制与预防中心(https://www.cdc.gov/fungal/candida-auris/fact-sheets/factsheet-lab-staff.html)推荐该体系用于临床标本中耳念珠菌鉴定的PCR法。

抗真菌药物敏感性实验


在明确系耳念珠菌导致的感染时,药敏试验结果可指导临床治疗。

4.1 耳念珠菌药敏试验的适应证


推荐9:

所有耳念珠菌分离株进行药敏试验。

非感染时,多重耐药耳念珠菌的分离有感控意义。


推荐10:

耳念珠菌导致侵袭性感染且之前抗真菌治疗效果不佳时,必须进行药敏试验。


推荐11:

耳念珠菌导致耳部感染,未进行抗真菌经验治疗、准备靶向治疗,或经验治疗效果不佳时,进行药敏试验。


4.2测试药物、方法和参数


常用的抗真菌药敏试验方法有微量肉汤稀释法(CLSI-BMD)、仪器法(Sensititre Yeast One、Vitek 2)和梯度稀释法(E-test)方法,这些方法检测耳念珠菌时最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)结果存在差异。

使用Vitek 2检测两性霉素B的MICs较高,而Sensititre Yeast One方法MIC值较低。

Sensititre Yeast One方法检测抗真菌药物敏感性的数据显示,氟康唑的MIC值很高,但其他唑类的MIC值非常低。

CLSI-BMD检测卡泊芬净的MIC可能会假性增高,一些研究还显示CLSI-BMD和EUCAST方法检测卡泊芬净敏感性存在实验室间差异。

一些学者推荐CLSI-BMD和E-test方法用于耳念珠菌的抗真菌药敏试验。


推荐12:

采用CLSI宏量肉汤稀释法为参考方法,测试5-氟胞嘧啶、唑类、棘白菌素类、两性霉素B的MIC。

操作和解释标准为CLSI M27 Ed4。


推荐13:

使用E-test法时,可以检测伏立康唑、卡泊芬净的MIC。

E-test法检测两性霉素B的MIC结果比参考方法低。


推荐14:

使用生物梅里埃Vitek AST YS07卡时,可以检测5-氟胞嘧啶、氟康唑、伏立康唑、卡泊芬净、米卡芬净的MIC。

其检测两性霉素B的MIC结果比参考方法高,结果不可信。


推荐15:

使用赛默飞Sensititre Yeast One®Y010时,可以检测5-氟胞嘧啶、氟康唑、伏立康唑、伊曲康唑、泊沙康唑、卡泊芬净、米卡芬净、阿尼芬净、两性霉素B的MIC。


推荐16:

目前没有使用ATB FUNGUS 3检测耳念珠菌耐药性的报道。

如果使用,需要进行验证和比对。


推荐17:

耳念珠菌试用性流行病学界值参照网站ht-tps://www.cdc.gov/fungal/candida-auris/c-auris-antifungal.html,见表1



4.3 耐药机制检测


在氟康唑耐药的耳念珠菌菌株中,ERG11基因所编码的氨基酸置换F126L、Y132F和K143R的发生率远高于敏感株。

另外,由于ERG11编码的羊毛甾醇14α-去甲基化酶(ERG11p)是唑类药物作用的主要靶位,故ERG11的表达上调也可导致需更高浓度药物与ERG11结合从而引起耐药。

FKS1基因参与编码1,3-β-D-葡聚糖合成酶,这也是棘白菌素发挥作用的靶点。

FKS1的热点区编码S639F突变可能导致耳念珠菌对棘白菌素药物的亲和力降低从而引起耐药。

同源性技术研究


推荐18:

耳念珠菌聚集性或暴发性出现时,须进行同源性分析。


推荐19:

根据文献,推荐以下同源性分析技术。

(1)脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE):

韩国学者用PFGE技术对耳念珠菌进行同源性分析。


判断标准为:

菌株之间条带大小和数量一致,则认为是同一型别;

1~3条条带变化则认为是高度相近型别;

4条及以上条带变化则认为是不同型别。


(2)多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST):

通过PCR扩增4个管家基因内部片段(RPB1,RPB2,ITS和D1/D2)并测定其序列,分析菌株变异。

利用该方法,韩国学者确定了ST2型的流行株,印度学者成功区分来自印度、南非、巴西、日本和韩国的104株耳念珠菌并构建系统发育树。


(3) M13 DNA PCR:

Chowdhary等用M13 DNA PCR技术对12株耳念珠菌进行基因分型,结果成功区分10株来自印度和来自日本和韩国各1株的耳念珠菌的不同基因型。


(4)全基因组测序(whole genome sequencing,WGS):

在病原体溯源的所有分子分型技术中,WGS因分析范围广而具有最高的分辨力。SNP是基因组中最为广泛的变异,代表不同个体之间的遗传差异。

基于全基因组的SNP分析(whole genome SNP,wg SNP)提供了更多的SNP位点,通过比较SNP信息可以对菌型进行更细致的划分。

临床诊断






临床处置












预防和控制


参考网站(https://www.cdc.gov/fungal/candida-auris/cauris-infection-control.html)信息,作如下推荐。

8.1 预防用药


推荐35:

耳念珠菌病发病率低,不建议预防用药。

特殊情况确需预防用药,用药建议如上述治疗建议。

8.2 监测






8.3 感染控制


推荐41:

明确耳念珠菌定植或感染时,应对患者进行标准接触隔离措施。

条件具备则单间隔离,或与其他耳念珠菌患者同一房间。

可以将相同多重耐药定植菌患者置于同一房间。

医护人员及探视者需在标准预防的基础上进行接触隔离。

患者用具尽可能选择一次性用品。


推荐42:

严格遵循手卫生规范。

对有耳念珠菌分离的病区,出入的医护人员、探视人员应严格遵守手部卫生规范,用流动水和皂液洗手,再用酒精擦拭。

戴上手套前和移除手套后需进行手部卫生,注意戴手套不能代替手部卫生。


推荐43:

减少设备共用,做好个人防护。

尽量使用一次性医疗设备,或在相同病例之间共用设备,或将感染患者安排在当天最后进行操作,结束时彻底消毒。

个人防护用品应在洗手后、进入房间或患者区域前穿戴好,离开前将个人防护用品在患者房间内脱下并丢弃,之后进行标准的手部卫生。

如果存在患者血液、体液、皮肤等接触风险时,应穿隔离衣;存在溢出或泼溅风险时需佩戴护目镜和面罩。


推荐44:

加强环境清洁消毒。

推荐参照网站(https://www.cdc.gov/fungal/diseases/candidiasis/recommendations.ht-ml)信息。

推荐使用含氯消毒剂1 000 mg/L、每日3次常规环境消毒或10 000 mg/L终末消毒,或氯己定葡萄糖酸盐消毒。

患者离开,应进行终末消毒。

使用非接触式消毒(如紫外线)前,推荐对患者环境中的所有物品进行清洁。

皮肤去定植,推荐2%氯己定;耳念珠菌感染患者接受心胸手术前的皮肤准备,推荐10%聚维酮碘。

新型消毒剂SCY-078可以抑制生物膜形成。耳念珠菌可存在于患者的床、手机、摇床控制器、地板,医务人员工作区域的椅子、床单、医疗仪器,门把手、壁橱、洗手池、便盆和墩布池;医院感染暴发时还见于公用的腋温计、公用的血压袖带。

耳念珠菌在潮湿和干燥的表面存活至少14 d,在金属和床单位等能够存在7 d,在污染的被褥中存活7 d,甚至可以存在数月。


推荐45:

对有定植或感染的患者,进行标签提示,转运时要有信息传递。

患者病房门口悬挂隔离标识。

对有耳念珠菌分离的患者,单间隔离的同时,尽量减少接触人员的数量。

尽量减少患者转运,如须转运应将其耳念珠菌携带或感染状态信息传递给相关人员,做好标准隔离措施。


推荐46:

正确处理与患者相关的医疗垃圾及生活废物。

垃圾集中处理,避免废物污染环境。

洗手池与清洗池分开。

任何时候不应在洗手池中丢弃或清洗污染的物品。

小结


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