查看原文
其他

六万播放量的B站单细胞课程

BIOMAMBA Biomamba 生信基地 2024-04-03


离最开始做单细系列课程已经过去一年多啦,原本也就是随便搞搞,没想到播放量越增越快,导致我不更完很难收场。目前我们的各类免费单细胞数据分析的课程基本都排在B站的头名,总播放量已经超过六万啦。如果说你还没有学过这些课程,可就太可惜了:


手把手教你做单细胞测序数据分析
https://www.bilibili.com/video/BV1S44y1b76Z?p=1



细胞通讯https://www.bilibili.com/video/BV1Ab4y1W7qx?p=1



拟时序分析
https://www.bilibili.com/video/BV1br4y1x7Hf?p=2




依次学完下面的内容,3~5分的SCI随便水(当然也不要真的去水文章)


单细胞数据分析系列教程:

B站视频,先看一遍视频再去看推送操作,建议至少看三遍:https://www.bilibili.com/video/BV1S44y1b76Z/
单细胞测序基础数据分析保姆级教程,代码部分整理在往期推送之中:手把手教你做单细胞测序数据分析(一)——绪论
手把手教你做单细胞测序数据分析(二)——各类输入文件读取
手把手教你做单细胞测序数据分析(三)——单样本分析
手把手教你做单细胞测序数据分析(四)——多样本整合手把手教你做单细胞测序数据分析(五)——细胞类型注释
手把手教你做单细胞测序数据分析(六)——组间差异分析及可视化手把手教你做单细胞测序数据分析(七)——基因集富集分析

上游fastq文件处理:
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件:cellranger
单细胞分析的最上游——处理Fastq文件:dropseqRunner有奖提问,这个smart-Seq2数据实战的比对率为何如此低?

细胞通讯B站连续播放起来比较方便:
https://www.bilibili.com/video/BV1Ab4y1W7qx?p=1往期推送单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》1.概论
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.1CellChat基础分析教程
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.2CellChat多组别分析
给你们申请到了免费的128GB云服务器
拟时序分析B站连续播放起来比较方便:
https://www.bilibili.com/video/BV1br4y1x7Hf?p=1往期推送单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》1.概论
单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》2.monocle概论单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》3.monocle2实操:完整版
单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》4.初识monocle3
单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》5.monocle3的降维、分群、聚类

其他单细胞相关技术贴也在这里:细胞的数量由誰决定?单细胞中应该如何做GSVA?答读者问(三):单细胞测序前景答读者问(四):如何分析细胞亚群答读者问(六):Seurat中如何让细胞听你指挥答读者问(八):为什么Read10X也会报错?
答读者问(十)整合后的表达矩阵,如何拆分出分组信息?
答读者问(十一)如何一次性读取一个目录下的cellranger输出文件?
给你安排一个懂生信的工具人(十):不学编程 零代码完成单细胞测序数据分析:Loupe Browser
什么?不做单细胞也能分析细胞类群和免疫浸润?
答读者问 (十三)查看Seurat对象时的ERROR:type='text'
各类单细胞对象(数据格式)转换大全(一)批量整理好GEO中下载的单细胞数据
答读者问 (十四)Seurat中分类变量处理技巧
答读者问 (十五)稀疏矩阵转matrix, as.matrix函数是下下策
答读者问 (十六)做单细胞测序到底需要多少内存答读者问 (十七)调用的线程越多就算的越快嘛?


单细胞文献阅读:文献阅读(三)、单细胞测序解析糖尿病肾病中肾小球的动态变化
文献阅读(四)、单细胞测序技术解析健康人与T2D患者的胰岛差异文献阅读(六)、小鼠全肾单细胞测序开篇之作文献阅读(七)、一篇不花钱就能白嫖的文章文献阅读(八)、不会吧不会吧,Nature都能白嫖?文献阅读(十一)、高氧下小鼠肺发育损伤的ScRNA图谱文献阅读(十二)、IgAN & STRT-Seq
文献阅读(十三)、老树开新花——EGFR、肿瘤、免疫+scRNA-Seq
文献阅读(十五)、癌前基质细胞驱动BRCA1肿瘤发生文献阅读(十八)、紧跟生信"钱"沿,胰腺癌&免疫多模态图谱
文献阅读(十九)、原发头颈癌和肿瘤转移微生态


非技术帖:关于单细胞的事 谈谈后面的计划趁机预告一波有关提高"Biomamba 生信基地"运行效率事宜
生信分析为什么要使用服务器?



如何联系我们


公众号后台中消息更新不及时,超过48h后便不允许回复读者消息,这里给大家留一下领取资料、咨询服务器的微信号,方便大家随时交流、提建议(由助理接待)。此外呼声一直很高的交流群也建好了,欢迎大家入群讨论:你们要的微信、交流群,来了!
大家可以阅读完这几篇之后添加笑一笑也就算了如何搜索公众号过往发布内容



继续滑动看下一个
向上滑动看下一个

您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存