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【NTT 2019演讲视频】新加坡基因研究所Yue Wan:使用直接RNA测序进行RNA结构研究

中国市场部 OxfordNanopore 2019-12-12


Yue Wan 博士 新加坡基因研究所


新加坡基因研究所的Yue Wan博士利用MinION进行直接RNA测序,致力于研究功能性RNA结构和了解其在细胞生物学中的作用。在今年5月的London Calling 2019全体大会上,Yue Wan博士为全球的科学家们带来题为“利用RNA直接测序探索转录组RNA结构”的精彩演讲,9月,我们邀请了Yue Wan博士在NTT 2019北京场和上海场为中国的学者们分享她及团队的直接RNA 测序研究经验与成果。


点击下方视频查看Yue Wan在北京场的完整演讲:


研究RNA如何折叠对于理解细胞内的RNA功能至关重要。传统获取RNA分子结构的方法是克隆小片段,酶切后采用凝胶电泳分析RNA分子的二级和三级结构信息,这种基于二代测序的方法尽管能够提供结构信息,但复杂、耗时长(约4-7天)、只能分析约100bp的片段,且缺乏沿转录本结构之间的连接性信息。


Yue Wan博士和团队利用纳米孔长读长进行直接RNA测序,快速准确地检测到RNA二级结构,验证结果显示与用传统测序的结果一致,除此之外,还可以看到RNA的二级结构在已知RNA上的动态。他们还对人胚胎干细胞转录组的结构进行探测,捕获到在其他高通量结构数据集中看到的结构特征,并检测到基因的各个异构体中的结构信息。表明,异构体之间的结构差异与差异翻译效率相关,进一步扩展了对细胞内结构和功能的理解。


会后,我们在现场对Yue Wan博士进行了采访,点击下方视频查看她如何看待RNA结构与人类健康的关系吧!



纳米孔RNA研究案例:



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