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背景:
新型冠状病毒肺炎被世界卫生组织(WHO)命名为COVID-19,也就是官方疾病名;而引起这个肺炎的病毒,之前被称作2019-nCoV,今天国际病毒分类委员会(ICTV)正式将其命名为SARS-CoV-2。
这就如同获得性免疫缺陷综合征(AIDS,艾滋病)是疾病名称;而人类免疫缺陷病毒(HIV)是引起AIDS的病毒名称。
SARS是指特指严重急性呼吸综合征,于2002年首先在中国广东发生,并扩散至东南亚乃至全球,直至2003年中期疫情才被逐渐消灭的一次全球性传染病疫潮。在SARS病毒后面加一个“-2”作为针对引起新冠肺炎的病毒命名,很容易让人感觉是2003年的SARS冠状病毒的延续。为此,我们特意请一直在美国做病毒研究的王宇歌博士,请他对这一命名做一解读。1,SARS-CoV-2和SARS-CoV亲缘性并不近首先需要说明的是,ICTV的SARS-CoV-2命名确实容易引起误会和混淆,因为新冠状病毒(姑且叫2019-nCoV)和SARS-CoV亲缘性并不近。1,从病毒看,2019-nCoV和RaTG13属于独立的进化分支;结合美国CDC网站的QA可以作为佐证,认为2019-nCoV不属于SARS-CoV,而是一种全新病毒;或者可以说,2019-nCoV属于SARS相关病毒。2,从病毒导致的疾病看,COVID-19(新型冠状病毒肺炎)和SARS是两种临床表现有诸多差异的疾病。因此命名为SARS-CoV-2可能会引起非专业人士的恐慌。2,ICTV正式命名为SARS-CoV-2的依据是什么?但病毒学命名本身就是个主观的行为,不排除今后会对其命名进行更新。最典型的例子就是Jon Cohen所说的HIV的命名。1983年HIV被Barré-Sinoussi等分离,但同时分离出该病毒的美国逆转录病毒学家Gallo将其命名为HTLV-III(人类嗜T细胞病毒3型)。而后Montagnier等证明HTLV和HIV相距甚远,属于同“科”不同“属”病毒,于是将其命名为LAV(淋巴腺病相关病毒)。直到1986年,LAV和HTLV才被重新正式命名为HIV(下图上)。
而HIV中又包含HIV-1和HIV-2,两者基因组也有较多差异。所以这个命名也有一定问题。我之前多次提到过HIV-1和HIV-2的分子起源。2000年Beatrice Hahn通过在非洲追踪SIV和HIV的序列发现了HIV-1的起源。HIV-1起源于黑猩猩亚种P.troglodytes所感染的SIVcpz,经过多个基因事件在1930年传给人类。HIV-2起源于西非,由猴sooty mangabey的SIVsm传播给人。所以HIV-1和SIVcpz更接近,而HIV-2和SIVsm及实验室恒河猴模型常用的SIVmac同源性更高(上图下);相比之下HIV-2和HIV-1同源性并不高,且两者引起AIDS的疾病病程有较大差异。但因为两者宿主都是人类,所以姑息将其同归属于HIV。这和SARS-CoV及SARS-CoV-2有一定相似之处,也是这次命名的考虑因素。本公众号推文仅为学术交流,不构成对临床诊治的意见。
编辑:Henry;微信号:healsan。图片来自于网络,版权归原作者所有。
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