《大咖论道》第一季（10）| 张浩：遗传病精准管理
导读
精准医学作为国家战略，从科研逐渐落地临床诊疗和健康管理。2017年，近百万的人群队列专项陆续启动；国产测序仪量产推动测序迈入百美元数量级；微生物组、云平台、结合组学和人工智能的数字生命开启；同时，基因检测应用场景尚不明朗，技术标准和行业规范亟待完善；而跨界巨头的进入、并购已经开始，又一轮浪潮或即将开始。
基于此，基因慧策划和主办，贝壳社提供媒体支持《精准医疗大咖论道》，第一季邀请十余位产业代表联袂撰文，梳理和展望科技创新、应用转化和产业发展，完全中立策划，旨在促进科研、临床、产业、资本之间的了解和连接。
往期嘉宾（点击可见文章）
本期嘉宾
【编者按】“资本寒冬”后，基因技术和市场依然势头不减，从FDA批准NGS伴随诊断产品到个人基因组有望迈入百美元时代，基因作为新的切入点成为疾病和健康管理工具，成为新宠，而同时理论上多数疾病是多基因病，和基因的具体关系尚待发掘，而关联关系较为清楚的是遗传病。第十期《精准医疗大咖论道》，基因慧邀请了专注遗传病精准管理的北京金准基因的联合创始人张浩博士撰文。回顾了2016年基因检测在遗传病临床领域的最新进展，并分享了遗传病基因诊断产品设计、报告解读、病人信息化管理等。
张浩
(北京金准基因联合创始人)
张浩于北京大学取得学士学位，随后赴美获得俄亥俄州立大学博士学位。于2010年，担任华大基因美洲分公司COO职务。积累了丰富的二代测序实验室运营管理经验，完备了国际制药公司组学业务的开拓能力。 2015年回国联合创立哈尔滨精准基因科技有限公司和北京金准基因科技有限责任公司。
图：张浩博士 （经作者授权提供）
遗传病的精准管理
作者：张浩（北京金准基因联合创始人）
一、基因检测从分子水平精准诊断
感谢基因慧的邀请参加本次《精准医疗大咖论道》活动，"精准医学"即根据每个病人的个人特征量体裁衣地制定出个性化治疗方案，其中，遗传病诊断是基因检测临床应用最显著的成果之一。
根据世界卫生组织公认的已经发现的遗传病（罕见病）约7000种；按发病率估算，中国目前约有1900万罕见病患者，其中超过一半是儿童，且1/3的患者寿命不超过5岁。遗传病的临床诊断通常存在儿童病患对症状描述不清晰、漏诊误诊的现象。罕见病的另外一大特点为绝大多数是基因变异致病。遗传病致病突变85%发生在外显子区域，以点突变或者缺失重复为主。
随着测序成本的下降和分析技术的提高，以二代测序技术为核心的基因检测正在被广泛应用于遗传病的科研和临床检测，从而帮助医生对遗传病患者进行精准诊断或及时干预。目前通行的诊疗模式为：
临床基因检测的流程（仅供参考）
1. 从临床传统诊断到基因检测
医生对病患进行初步诊断，必要的时候抽血开基因检测单，并抽取患者的血液样本。
2. 第三方检测机构基因测序分析
第三方检测机构取样，测序，数据分析，经过1-2个月，检测结果交给患者
3. 临床医生对基因检测结果解读
医生综合病人临床表征和基因检测结果，对病患基因检测报告进行解读，给予治疗或者干预的建议。
4. 随访管理
建议医生对患者进行随访注册。有条件的患者接受医生的长期管理。
二、临床基因检测Panel及产品设计
遗传病病种众多，同时加上有的遗传病发病率低，迟发性，外显率等因素，对于遗传病诊断，什么样的基因检测适合于什么临床表型的患者，就是临床医生普遍关心的问题。这些方面我们有这样一些探索和实践。
1） 科室专用 panel
我们根据自有数据库和公共数据库，对各个科室的常见遗传病做了总结。比如眼科，我们就针对遗传性眼病的所有已知基因设计了panel , 可以一次性检查数百个基因。患者接受检测后，患者和眼科医生即可了解病因是否是由已知基因突变引起。
2）基于临床表型定制panel
通过自动化表型关联基因型工具。医生在系统里输入临床表型特征后，根据HPO国际标准数据库和我们自有数据库关联出可能的基因型。根据关联的基因型，我们可以相应设计panel，对病患进行有的放矢的检测。
3）全外显子测序
对于临床表型复杂的病患，我们提供亚全外（JZ5000）和全外显子测序。 JZ5000包括所有目前公共和我们自有数据库已知的5300余个致病突变基因。全外显子则包括人类基因组上所有的25000余个基因。使用亚全外和全外可以几乎全面的检测所有致病突变。同时配合明鉴系统，可以大幅减少分析和解读所需时间，尽快找到病因。
三、病历信息化和病患随访管理
CHPO总协调人，知名的神经遗传专家中日友好医院的顾大夫经常在病友群和博客上呼吁病人看病时携带病例、用药信息等。而缺乏信息化的病历管理往往在用户教育上花费很多经历，对于临床医生和患者都有很大困扰，包括多个病历的不系统化、信息的丢失等等。建议信息化管理工具，同时方便医生和患者进行病历管理、用药信息管理、以及基因数据管理，对于遗传疾病的精准诊断和长期健康管理非常重要。
四、基因检测数据的自主质控
目前从事基因检测的第三方机构众多。测序和分析，在行业内尚没有统一的规范和标准。而基因检测的结果将直接知道病患的临床治疗干预方案。所以， 38 39723 38 15289 0 0 3462 0 0:00:11 0:00:04 0:00:07 3462当测序报告返还给临床医生后，临床工作者就面临着巨大的压力，如何判断测序和分析的质量、报告选点的准确性，移动互联网工具以及信息技术的发展，可以允许医生将从任意第三方检测机构获得的数据上传至云端，在线分析时自行设置参数，筛选突变类型，携带率等。这样发挥医生端的能动性，把控数据质量，从而确保最终诊断的准确性。
除对病患的临床诊断之外，遗传病医生的另外一个重要需求是科研工作。大量的罕见病存在未知致病突变。去年的9月份，国家重点研发计划罕见病研究项目正式获批启动。本项目的目标是形成网络化、结构化的中国罕见病大数据采集和共享平台。所有这些项目的开展会进一步拓展我们对于遗传病的分子机制的认知，从而反馈到临床的应用。在这类应用场景中，更多关注的是新的突变（novel mutation)，对于临床科研医生而言，除了拿到第三方检测机构给的基因检测结果外，有必要对数据的质量，以及参数的个性化设置，以及结果的可视化从原始数据判断，这些都离不开便捷地、方便临床医生使用的分析管理工具。
图：金准基因加入The Human Variome Project
五、解决临床医生的“痛点”
以上提到的临床医生的“痛”，如何结合信息打“通”是关键。帮助临床医生更加快捷、系统地整合数据信息，使用软件工具，从而建立辅助诊断系统和临床知识库，是实现精准医学重要的步骤。这里很多企业做了很多实践和探索。我们从开始的“明鉴单基因病辅助诊断系统”基因型和表型的关联；到后来开发的“明睿单病云管家”提供线上基因数据自主分析、病历信息化管理等工具，解决临床的病人信息碎片化、数据质控、基因和表型数据整合等问题。基因检测领域有很多的方向，我们专注于遗传病方向，在这个和基因关系相对确定的方向深耕，帮助临床医生更好地落实精准医学，解决病患的问题。一年以内，也承蒙200多家医院和近1000名临床医生合作伙伴的信任和支持，我们在已经分析的20000个样本基础上，会更多思考提供切合临床应用场景的基因检测服务和工具平台，推动精准医学的向前发展。
基因测序正在迅速成为主流的诊断方法。 患者和医生需要建立临床辅助诊断系统和知识库、降低生物信息分析门槛。第三方检测机构要充分发挥利用自身在测序方面的专业性， 以病患和临临床医生的需求为指导，在遗传病诊断领域里将大有可为。
【后记】
感谢张浩博士参与第十期《精准医疗大咖论道》。
与张博士认识并有过交集的人都能感受到他的逻辑性以及内敛，正如金准基因从哈尔滨到北京，短短一年内，专注遗传病领域并持续发力。同时，我们公众媒体上很难看到金准的高管们的声影。行业需要更多高调做事，低调务实的企业，而我们本期大咖论道有幸邀请到了张博士在公众媒体上首次发声，让更多的读者了解低调的创业者以及企业，增加相互连接和合作，2017年市场竞争将更加残酷，野蛮人是否会入侵，沉静的守门人是否会有更多的发声和联合，让我们拭目以待。
您有什么感想和对张博士的提问，欢迎后台留言。
下一期嘉宾：陈钢（WeGene联合创始人）
附赠（每位嘉宾所在企业大事记）
金准基因大事记
哈尔滨精准基因科技集团成立
2016.01加入The Human Variome Project
2016.02黑龙江金准医学检验所获得黑龙江省卫计委审批顺利通过
2016.03黑龙江金准医学检验所获得PCR实验室试运营资格
2016.04发布“明鉴单基因遗传病分析系统”
2016.06与北京天坛医院共建联合实验室
2016.08与复旦大学附属儿科医院达成合作，加入十万新生儿基因组计划
2016.09作为主持单位承接黑龙江省发改委出生缺陷技术示范中心
2016.11国内首款单基因遗传病云管家“明睿”系统正式发布
2016.12通过“国家高新技术企业”认证
......
基因慧独家策划的《基因三人行》之《温故2016》活动，已邀请行业细分领域代表性企业和专家参与，第一期临床基因检测播出反响热烈（点击链接），第二期肿瘤基因检测、第三期微生物组和第四期基因云平台，即将播出，敬请期待。
【大咖】 郝向稳 | 秦楠 | 阎海 | 张云鹏 | 许明炎 | 柴应爽 | 熊磊 | 孙洪业 | 尹烨 | 高福院士 | 李继承 | 黄尚志顾大夫王奕鸥《基因三人行》 | 哈佛沈亦平 | 神经遗传专家顾大夫 | 华大基因王威 | 自闭症专家王明帮 | 许明炎 | 15位CEO解读液体活检 | 王奕鸥 | 精准医学专项专家
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