2016年11月7号注册了这个公众号,《为什么要开这个公众号》一文中写了开公众号的目的,这里收录了过去一年不到的时间里写的179篇文章,多半是介绍我自己的软件包。这个目录诚意推荐大家做为8天假期读物!
CS0: ChIPseq从入门到放弃
CS1: ChIPseq简介
CS2: BED文件
CS3: peak注释
CS4:关于ChIPseq注释的几个问题
CS5: 吃着火锅,唱着歌,还把分析给做了
富集分析
clusterProfiler for enrichment analysis
why clusterProfiler fails
buildGOmap
非模式基因GO富集分析:以玉米为例+使用OrgDb
dotplot展示富集分析结果
为什么画出来的点比指定的数目要多?
DAVID分析结果转为enrichResult
DAVID functional analysis with clusterProfiler
enrichDAVID支持自定义背景
SCIENCE文章用了DAVID被吐槽
Comparison of clusterProfiler and GSEA-P
听说你有RNAseq数据却不知道怎么跑GSEA
搞大你的点,让我们画真正的气泡图
听说你也在画dotplot,但是我不服!
dotplot for GSEA
enrichment map
joyplot:GSEA的结果也能快乐起来
gseaplot自定义颜色
看完此文, 你也能够大开脑洞, 上升逼格
emojifont包
画❤️装geek什么的,都弱爆了!😜
emojifont新功能(有视频哦)
phylomoji:用emoji画进化树
你所没见过的苹果
ggimage:ggplot2中愉快地使用图片
geom_pokemon: 使用pokemon画图
大开眼界+多图慎点:Pokémon x NBA and other fun with ggimage
你的专业是那一只Pokémon神兽?
Ask me anything about ggtree
当年ggtree发布文,为整合数据而生!
ggtree无根树及注释
ggtree版本的plotTree
align genomic features with phylogenetic tree
ggjoy facet with ggtree
reproducible logo generated by ggtree
用ggtree重现Figtree的示例进化树
用户数据注释进化树
使用自己的数据来给进化树上色
bootstrap分段标记
xlim_tree: set x axis limits for only Tree panel
reverse time scale
vertical dendrogram in ggtree
中空的环形树
交互式操作进化树
可视化操作树的拓扑结构
facet_plot: 加图层到特定的分面上
facet_plot:加图层到特定分面,方法二
facet_plot: 关联数据和进化树的通用方法
漫画版的进化树你见过吗?
Phylogenetic trees in R using ggtree
Growing a ggtree
Growing a ggtree - part 2, adding tip shapes
[GOSemSim]: 跨物种计算基因相似性
ggtree hex sticker
ggtree hexbin sticker投票结果
一大波贴纸来袭
scatterpie:离散饼图
邪恶的我画出了善良的饼图
DNA序列差异作图
树变图,图变树?
treeio: 进化树基础类和方法
食色性也
prettyB: 美化B
R包辣鸡之CorMut
来自R的桌面提醒
有魔性的图来一发
再见joyplot
听说你想学R?
我在MSnbase里做了什么?
clifun: 在R里装装逼
Update R packages
无中生有windows版R包
R binary is untrustable
R kernel in Jupyter notebook 3
你所不知道的,R的N种打开方式
R,python喊你回家吃饭啦
Use ggplot2
ggplot2作图5招:《R入门25个菜谱》中所有图片的ggplot2版本
ggplot2字体溢出的那点破事
wrapping labels in ggplot2
一次解决ggplot2所有字体
根据GTF画基因的多个转录本结构
如何画类似MEME的注释序列
joyplot:一种波涛汹涌,哦不对,是山峰叠峦的可视化方式
邪恶的曲线
draw batman logo
按地理位置分面
ggplot2分面之像素艺术
Five things biologists should know about statistics
什么是T检验
富集基因之注释缺失
落入窠臼
boxplot
如何告别单身
TALEN基因编辑
生物实验的基本原理
纯文本可视化FASTQ质量数据
a simple gene finder
搭建本地blast
blast一大坑:无法输出query sequence title
如何获取文献
在这个看脸(哦不对,看图)的时代,做科研的你怎么能错过这个帮你找一张漂亮脸蛋的神器!
什么?听说你有文章却不知道该往那里投!
sci-hub如果挂了,你还有神器下文献吗?
听说你也在读文献
什么?杂志要求图片要300dpi的TIFF,还限制了文件大小,臣妾做不到啊
[连载1]:学术期刊的学术不端,你见过吗?
[连载2]:Editor你的心不会痛吗?
[连载3]:辣眼睛,一篇抄袭引发的系列血案!
[连载4]:我像是一颗棋,进退任由你决定
从业超过10年,未见过如此厚颜无耻之人
活久见,抄袭竟是重用他人代码没有致谢?
祝你们缠缠绵绵到天涯
科学网文章:BMC Systems Biology没有学术不端
大学教授力挺抄袭,强行洗地到裤衩都不要了,到底图什么?
关于重用代码与文章抄袭
十年前截屏
开源的macOS和linux版微信
OSX版BioEdit
你们想要的: Linux装windows的二逼
你们想要的:QQ跑在Linux上
linux版迅雷
度娘才是最大的老司机
软件更新大法
scau校园网认证
ubuntu安装只有redhat版本的454分析软件
安装黑苹果
Powerbook G3上安装gentoo
安装os9和netbsd双系统
Edit partition table in NetBSD/macppc
use linux desktop again
Xming-windows下远程linux桌面
realvnc:各种设备互联
合体中的操作系统
为什么要开这个公众号
关于《关于转载》
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怀疑人生!我不欠你们钱,好吗?
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利用多边形估计Pi值
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科研人员必备特性:拖!拖!拖!
中国人民的翻墙情结
来香港读博其实是被逼的
博士养成记
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博士版2048
3D版邪恶的曲线
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