三分钟绘制一张优美的三维PCA图 | 云平台
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种降维的数据处理方法。从生物学的应用上来说,其主要目的是判断组内样本的重复性是否足够好(图上距离较近),组间样本的差异是否足够大(图上距离较远)。若PCA分析结果不好,则后续差异分析结果不可靠;若存在离群样本,可剔除该样本再进行后续分析,以确保后续结果有意义。
PCA分析会得到贡献程度由大到小的多个成分(PC1、PC2、PC3.....),三维PCA图就是利用前三个维度进行作图,从而在三维空间中查看样本的分布情况。
本文主要为您迅速绘制一张优美的三维PCA图提供步骤指导(1-4要点),另附细节优化方法(5及之后的要点),可后期慢慢研究调整,同时提供相关分析方法说明和参考文献,为您深入了解提供支持。
1.了解输入数据格式
2. 上传数据(以示例数据为例)
3. 设置分组(若无需设置,跳过此步)
4.图片下载
5-1.细节优化:自定义点颜色
5-2.细节优化:在“主要参数”页中调整
5-3.数据处理:分析方法+参考文献
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