【文献汇编】10月，33篇必读微生物研究：癌症、微生物药物、脑肠轴、皮肤-肠道轴、共生病毒、阴道微生物、菌群免疫互作、肠道黏液、粪菌移植

在过去，一个普遍认知是Ⅱ型糖尿病可以通过改变饮食和增加锻炼的方式加以预防。但近日，由多个中国机构组成的研究小组发现，运动对糖尿病人葡萄糖代谢的改善也受肠道微生物的影响。相关结果发表在同期的《Cell

所以，知几未来研究院也不建议大家贸然尝试，对于益生菌治疗方案也最好保持谨慎的态度。实际上，婴儿肠绞痛存在自愈的可能，且国际上现有的实验证据还不足以完全支撑益生菌用于肠绞痛的广泛适用性。

值得注意的是，如果在感染克雷伯氏肺炎菌菌株之前，分别在分娩前一天和分娩后几天两个时间段对母犬使用抗生素（庆大霉素和万古霉素）；那么幼犬患败血症的几率也是有差异的：接受庆大霉素治疗的患病率更高。

Microbiology》上一篇最新综述，全面盘点了截至2019年5月1日前，来自314家机构的407个目前在研的临床抗菌药物。并重点关注了革兰氏阴性病原体，特别是世界卫生组织优先细菌清单上的细菌。

每个人每小时大约会喷出3700万个细菌，这意味着我们的微生物组不仅处于身体内部，还会不断地扩散到周围的环境中。我包罗万象，但也只“包罗”了一部分，剩下的像鲜活的光环一般围绕着我，延伸进周围的世界。

当时，该团队在小鼠模型中发现，黄腐酚（XN）以及它的两种氢化衍生物α,β‐dihydro‐XN（DXN）和tetrahydro‐XN（TXN），可以改善葡萄糖耐受不良、胰岛素抵抗和对瘦素的敏感性。

于是，研究人员推测，可能是由于非无菌小鼠和人体中存在的某些致病细菌在肺发育不良的发病中发挥了重要作用，可能的方式包括调节肺促炎信号和中性粒细胞的炎症反应（neutrophilic

母亲孕期健康对于后代有重要意义。妊娠期间，母体微生物群可通过母体免疫反应、微生物代谢物等母体因素，间接影响胎儿；也可通过饮食、压力、神经内分泌暴露等更间接的因素，介导胎儿表观遗传学上的改变。

特应性儿童经常有对食物抗原(通常是花生或坚果)过敏的证据，即使以前没有进食过这种食物。因此致敏儿童是通过与口服无关的途径接触到食物抗原的，可能是通过皮肤接触过敏原如花生酱，或者含花生过敏原的油脂等。

“所有这些变化都是健康状况得到改善的间接标志，这为肠道微生物群确实有益心血管疾病的假设提供了更多的证据”，来自威斯康星大学麦迪逊分校（University

母亲孕期健康对于后代有重要意义。妊娠期间，母体微生物群可通过母体免疫反应、微生物代谢物等母体因素，间接影响胎儿；也可通过饮食、压力、神经内分泌暴露等更间接的因素，介导胎儿表观遗传学上的改变。

有研究显示，大约2-3成接受化疗的患癌人群，在之后的生活中会出现记忆、说话流畅和其他认知功能方面的变化。许多幸存者报告说，在执行多线程任务、理解和记忆等方面出现困难，非常影响生活品质。

abscessus）耐药菌感染。匹兹堡大学的Hatfull团队，根据病人情况配制了三种噬菌体（Muddy、ZoeJ、BPs）鸡尾酒，静脉注射6周后，患者的肝脏感染基本消失。

可能直接参与和影响了这一过程。这是两种普遍存在于肠道和口腔的厌氧菌：在慢性阻塞性肺疾病患者的肺中发现有较高丰度的这两种细菌存在；而在健康成年人中，它们则被发现与亚临床气道炎症（subclinical

有研究显示，大约2-3成接受化疗的患癌人群，在之后的生活中会出现记忆、说话流畅和其他认知功能方面的变化。许多幸存者报告说，在执行多线程任务、理解和记忆等方面出现困难，非常影响生活品质。

11月2日，国家药品监督管理局有条件批准了绿谷制药治疗阿尔茨海默病新药——“九期一”（甘露特钠，代号：GV-971）的上市申请，填补了这一领域17年无新药上市的空白。

GV-971的随机、双盲、对照三期临床试验在中国进行。来自中国34个地区、818名50-85岁、被诊断患有轻至中度阿尔茨海默症的患者，随机分组口服药物或安慰剂450毫克/次，每日两次，持续36周。

(PYY)的产生，这两种肽能增加胰岛素的分泌，影响能量的摄入/消耗。此外，SCFA诱导的FFAR2/3信号也能参与调节免疫细胞功能，如抑制IL-8来抗炎，目前已知IL-8可诱发糖尿病和炎症。

“这意味着，肺功能异常与某些细菌有关。口腔微生物在HIV慢性肺部疾病的发病机制中起独特作用。我们所观察到的这些特异细菌，也许可以作为HIV患者肺功能障碍的生物标志物”，杨博士说。

在第三部分“菌群检测及益生菌个体化定植”，我们还汇总了微生物在疾病干预和应用中的案例及相关临床指南，针对医生在临床上补充益生菌的普遍困惑，提供辅助信息：

早期数据显示，pCR和非pCR患者肠道菌群结构的组成差异无显著趋势；但在有3个时间点样本的5名患者中，观察到完成NACT后，应答缺失与拟杆菌（Bacteroides）的丰度增加有关。

该研究揭示了人类肠道微生物是如何分解加工食品的——尤其是在现代食品制造过程中经常产生的潜在有害化学变化；并提出了一种可能性，即利用肠道微生物组的这些知识来帮助开发更健康、更有营养的加工食品是可行的。

GV-971的随机、双盲、对照三期临床试验在中国进行。来自中国34个地区、818名50-85岁、被诊断患有轻至中度阿尔茨海默症的患者，随机分组口服药物或安慰剂450毫克/次，每日两次，持续36周。

细菌的基因检测结果，已确定供体粪便为患者感染源。这项研究，是与FMT胶囊耐药菌转移直接相关的患者死亡事件。它提示各位研究者，严格的捐赠者筛查是预防患者感染的重要手段，尤其对于那些免疫功能受损的患者。

他们收集了华东、华中和西北地区的486份来自健康人、肝硬化患者、早期肝癌患者粪便样本对其中419份样本进行了Miseq测序，发现在早期HCC患者中，丁酸盐生产菌——包括Ruminococcus,

总体上看，微生态活体药研究进展比较快，大部分都已进入临床研究阶段，且多处于II期，少数几款已进入III期。按照这一趋势，如果顺利的话，2-3年后，将有数种用于治疗CDI、IBD的微生态药物上市。

七种变形杆菌Sutterella、Oxalobacter、Desulfovibrio、Bilophila、Heliobacter、Pseudoalteromonas、Succinivibrio与

结果显示，尽管抗生素诱导了ABX小鼠的菌群变化（其菌群丰度比对照组小鼠低了600倍）；但在恐惧条件作用后，两组小鼠都习得了正常的恐惧反应；唯一的区别是，在灭绝学习中ABX小鼠的消退学习能力明显受损。

近期，刊登于《美国国家科学院院刊》上一项最新研究指出，环境中发现的低浓度抗生素还可能对肠道细菌产生重大影响，包括肠道细菌群落的结构变化、细菌种群数量严重下降等；其中，肠杆菌数量甚至下降了1000倍。

在与人类和动物相关的标本类型中，大肠杆菌菌株和ESBL类型占主导地位。内环显示ESBL大肠杆菌的来源；中环代表每个ST的分离株数量与每个ESBL的关系；外圈表示ESBL型分离株的数量。

并且，四个支系之间和内部，功能多样性还存在相当大的差异；其中，B支系是最不相似的——这一支对硫代谢和同化能力被大大加强，而其他支常见的功能如碳水化合物代谢及β-半乳糖苷酶功能却是缺失的。

自从1928年弗莱明发现青霉素以后，真菌的抗菌活性已被研究了近百年时间。其后包括链霉素（一种从霉菌中提取的药物）在内的其他发现进一步阐明，看似简单的有机体，是如何产生复杂生物活性分子的。

近期，刊登于《美国国家科学院院刊》上一项最新研究指出，环境中发现的低浓度抗生素还可能对肠道细菌产生重大影响，包括肠道细菌群落的结构变化、细菌种群数量严重下降等；其中，肠杆菌数量甚至下降了1000倍。

调查数据显示，B族链球菌对头孢菌素、氨苄西林、万古霉素、美罗培南和利奈唑胺100%敏感。但研究人员观察到，部分患者对四环素（80.1%）、红霉素（78.3%）和克林霉素（68.2%）敏感性降低。

这项研究还解开了一个20多年来有关棕色脂肪的谜团：BCAAs如何进入线粒体，并在细胞中产生能量和热量——科学家们发现了一种新蛋白质（称为SLC25A44），它控制着棕色脂肪清除血液中氨基酸的速率。

“在这里，我们发现大自然已经进化出了一种能力，它可以解除难以对付的微生物的武装，而不是杀死它们。由于微生物不用面临生存的压力，也就不会产生相关抗性，同时，还有助于创造和维持一个多样化的微生物群落”。

虽然该研究结果尚不能立即应用于人类治疗，但对于帮助理解轮状病毒感染的倾向性仍有所帮助，同时，还提供了一种潜在的机制来解释不同人群对肠道病毒感染的易感性差异，以及未来开发抑制和治疗病毒感染的新型策略。

该研究揭示了人类肠道微生物是如何分解加工食品的——尤其是在现代食品制造过程中经常产生的潜在有害化学变化；并提出了一种可能性，即利用肠道微生物组的这些知识来帮助开发更健康、更有营养的加工食品是可行的。

Adriaenssens评论认为，下一步的工作是解开病毒群中主要参与者的功能角色。“我们需要能够将噬菌体与其宿主连接起来，为此，我们需要良好的细菌和噬菌体培养系统，以及测试它们的模型系统”。

而此次，Aykut团队的研究结果，揭示了真菌在癌症进展中的一个过去从未被重视的作用，并提出了潜在治疗方案。这意味着，对特定人群的微生物群落进行改善，或将极大助力PDA这种致命癌症的治疗。

患者C则前后接受了三次VMT，中间还更换了供体。原因是她在接受供体1的两次VMT后好转，但在4.5个月后出现复发。更换至供体3后，所有评分正常，以乳酸杆菌为主的菌群也在随访的11个月内持续。

另一方面，作者强调了跨界微生物的相互作用，比如病毒和真菌。少数研究同样报告了真菌群落的变化，比如CRC菌群中马拉色菌Malassezia的增加——而细菌和病毒之间的跨界串扰可能在CRC中起重要作用。

Nobel留下财产的数额相当可观，超过3100万瑞典克朗（放在今天，大约为17亿200万克朗），这些钱被用来成立了一支基金，投资收益“每年以奖励形式，分发给那些在前一年给人类带来最大利益的人。”

“常见的极端干预措施对许多人来说很难实现。但是，我们的研究结果表明，至少在五年内，只要稍微减轻10%的体重，就有可能缓解2型糖尿病。这可能是一项让患者更有动力的研究，因为这个目标更易实现”。

2017年，由上海瑞金医院和华大合作的一项全基因组关联研究和血清代谢组学分析，对比了中国年轻人中的胖瘦群体，提示肠道微生物种类与循环代谢产物的变化与肥胖有关，并鉴定出了相关的肠道菌群物种。

Pulendran博士说，“我们的研究说明，即使在肠道菌耗尽的情况下，免疫系统的记忆也能对从前遇到过的病原体作出反应。但在面对新的致病因子时的迟钝反应，则突出了微生物在调节人类免疫中的关键作用”。

在本篇综述中，研究者提出了在设计工程微生物时，迭代DBTL框架的关键要素，重点分析工程微生物的设计过程、合成组建方法，包括每种方法下的最佳实践案例以及一些分析微生物组分功能的新兴工具。

species能降解饮食中的复合草酸盐——这是一种主要的肾结石的危险因素。因此，在为患有肾结石的个体中设计饮食时，除了需要避免富含草酸盐的食物；同时，也可以考虑提高能有效降解草酸盐的微生物水平。

美国粪菌银行OpenBiome可以为全美地区提供服务，每一个美国人在2小时车程内均可以找到与OpenBiome合作，提供专业FMT治疗的医疗机构。此外，它还为西班牙粪菌银行Ramony