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精选100篇 | 生信者言

生信者言 生信者言 2022-03-29

  R画图 


柱状图 Bar Chart 

热图 Heatmap

散点图 Scatter diagram

箱形图 Boxplot 

维恩图 Venn Diagram

饼图 Pie Graph 

火山图Volcano Plot

颜色设置

绘图顺序调整

主题设置工具ggthemr

显著性添加工具ggsignif

标签遮盖问题处理工具ggrepel

相关性矩阵可视化工具corrplot

图表配色方工具ggsci

高颜值进化树ggtree

数据整合dplyr

数据整合tidyr

画图字体选择

一页多图与子母图

R语言最强脱单攻略(附代码)



 微生物数据分析 


宏基因组流程软件与数据库合集(上)

宏基因组流程软件与数据库合集(中)

宏基因组流程软件与数据库合集(下

句句干货!一文读懂宏基因组binning

9个模块+40余款软件+老司机辣评 | 16S信息分析流程软件和数据库合集

美国人体微生物组诸多计划最新盘点与评述 | 2017年10月

欧洲人体微生物组计划最新盘点与评述 | 2017年11月




 人类基因组分析 


NGS数据格式演化简史

如何进行基因组序列比对?

如何进行SNP/InDel检测及其影响因素?

详解生存分析(Survival analysis)

详解三款剪接位点预测软件

VarCards:人类基因变异与临床信息整合数据库

SVmine:新算法可提高基因组结构变异的检测能力

两种方法的应用--诊断试验与相关分析

Logistic回归---实例分析

北京田园洞人捕获测序:软件、算法、数据库一览



 转录与表观分析 


Circular RNA研究必读干货

DNA甲基化数据的统计与整合分析

Oxford Nanopore 在甲基化研究上的应用

CD-HIT:一款快速便捷的去冗余工具

Science特刊解读 | 单细胞基因组学研究技术的发展

Science特刊解读 | 单细胞转录组在先天免疫反应研究中的进展

38位“人类细胞图谱计划”首批项目的入选科学家介绍



 动植物基因组分析 


动植物变异检测经典生信分析流程

群体遗传中的主成分分析及其解读

单体型网络(Haplotype Network)的构建及展示

榴莲基因组首次发布

25 Genomes Project启动详情



 实验室技术类 


ICG:首个实时定量PCR内参基因知识库

引物设计的10款软件(经典款+在线款)

如何拍一张好看的细胞核?

DeaLT:精准细胞谱系示踪技术



 科研论文工具类 


图片编辑神器Inkscape

Graphpad Prism轻松搞定论文图标

Graphpad Prism一步步轻松搞定文献中的组合图&生存曲线图

编辑SVG格式图片的一个简单方法



 Perl编程技巧 


数据结构入门

哈希和子函数

正则表达式

正则实例:如何从海量序列信息中提取目标序列

字符串操作与排序

字符串使用实例:如何截序列

输入、输出与控制结构

文件测试和目录操作



 果然科学 



肉食者只是臭屁,素食者却毁天灭地——肠道菌群与放屁这件大事

生命信息与能量交叉路口的那个分子——磷酸基团的故事

基因也能共享? 它们的经济理念领先人类20亿年!

不是针对谁,你们的基因里到处都是垃圾!

万圣节基因家族Halloween Genes | 如果果蝇也有亡灵,你会害怕吗?

永生传奇:HeLa

进击的朊病毒

仓鼠有三宝:卖萌、模型、细胞好

猪、CRISPR与器官移植

二师兄之前世今生

是什么让我对猴子肃然起敬?

生命炼金术(1)---蓝血贵族

生命炼金术(2)---魔力镶嵌

生命炼金术(3)---金碳奇缘

人生苦短,无辣不欢

丧尸来了:从坟墓中长出的神经

“性别”可能误导医学研究

你真的了解母乳吗?

不运动,不流汗的“减肥神药”,代号516

处处留心皆食物 |《小森林》的四季野菜日历



 科研圈2017必看 


中国名单 | 2017高引用科学家(Highly-Cited Researchers)

2017年中国科技论文统计结果 | 最新发布

《2016年全国科技经费投入统计公报》发布,附官方解读

“双一流”建设学科名单(生物与医学相关)



 测序圈2017必看 


阿里巴巴投资的Prenetics公司

生物信息可视化软件公司Genialis

细节曝光!Oxford Nanopore真机还原,听听圈内人怎么说

ONT London Calling 2017精彩回顾

七夕节,我们采访了11位在测序公司工作的女生

学术会议怎么参加才能有收获?



 喜马拉雅有声阅读 


有声科普读物《众病之王:癌症传》

合集收藏帖丨一分钟听懂NGS基础概念

故事FM丨亲爱的姑娘,你值得被温柔以待




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《亲爱的姑娘,你值得被温柔以待》,11个真实的人物故事

《众病之王:癌症传》,一起聆听人类对抗癌症的斗争史

回复文字:果然科学,看一篇好玩的科普文。

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