用于构建人类剪接体数据集。我们从PDB服务器(https://ftp.wwpdb.org/pub/pdb/derived_data/index/entries.idx)

ATXN1-CIC相互作用对小脑浦肯野细胞中SCA1发病机制至关重要先前的研究表明，人类ATXN1的AXH结构域中的氨基酸V591和S602对于其与CIC的相互作用以及在小脑PCs（Purkinje

A2）、CCNB2（CyclinB2）的表达（a）；蛋白质组学测定的PCNA、14–3–3σ、CHEK1的相对强度（b）；用浙贝丙素处理的A549细胞中p-p53/p53的相对密度（c）。5.

Discovery软件进行成分分析。我们在总正离子（图1a）和负离子（图1b）离子色谱图（补充表1）中共鉴定了151种化学成分。表1显示了前15个主要成分。表1

2019年以来开发的糖蛋白质组学软件工具概述软件工具根据搜索类型和支持的糖肽以及是否提供了控制多糖FDR（错误发现率）的方法进行分类。最近更新的常用的糖蛋白质组学软件工具也列在下表中a.

Research（NAR）上一次更新文章发表以来PX的主要发展。联盟的六个成员是PRIDE、PeptideAtlas（包括PASSEL）、MassIVE、jPOST、iProX和Panorama

2a）。这些数据共同证明了CDK2和nsp12之间的相互作用，这使得CDK2能够促进RdRp活性，如图1所示。为了测试CDK2是否直接与nsp12结合，我们因此通过生物层干涉测定法（BLI

编译文献解读：将英文文献编译成微文（注：通过自己的理解，整理文献内容，编译成微文）。形式：长篇解读。可点击下方链接参考往期微文。长篇解读微文（例）：科研

i，MG132和ONX0914的成对相关图——两种强相关的蛋白酶体抑制剂。对于所有成对相关图（c、d、g、i），所有x和y轴均表示为log2(FC)（化合物与DMSO），并报告Pearson

BYHW改善I/R诱导的大鼠大脑皮层梗死损伤如图2所示，活体组织的TTC染色为深红色，右半球的梗死区域为白色。模型组的梗死面积比（21.73%，P

disease译名：免疫蛋白质组学分析揭示了长期患有COVID-19的个体呼吸道中的异常免疫细胞调节期刊：ImmunityIF：43.474发表时间：2022.03通讯作者：James

1A）。根据WHO中枢神经系统肿瘤分类标准（第五版）对所有肿瘤进行组织形态学和免疫组织化学分类。此外，我们使用全基因组甲基化分析和拷贝数变异(CNV)分析对所有肿瘤(epi)进行了遗传表征。图1.

2和补充表2）。正如预期的那样，共享大量序列同一性的激酶在其最佳底物基序中显示出高度相似性。然而，我们发现许多情况下，PSSM聚类分析并不能严格概括，从其一级序列推断的激酶之间的进化系统发育关系（图

氨基酸缺乏导致的核糖体移码研究揭示了一种专注于延长核糖体的机制，肿瘤细胞通过这种机制克服延长抑制和相关的应激信号来抑制翻译。核糖体碰撞导致碰撞传感器ZAKα的激活，ZAKα介导p38/c-Jun

sequencing译名：通过邻近测序定量单细胞中的胞外蛋白、蛋白质复合物和mRNA期刊：Nature

T细胞中，TN的中心记忆（TCM）细胞的频率降低，而TNs中TTM和TEM细胞的频率比HCs中更多（图2C）。虽然ART长期抑制HIV-1复制，但T细胞亚群的分布并未完全恢复。在INRs中，CD4+

点击蓝字“蛋白质组”,轻松关注不迷路生科云网址：https://www.bioincloud.tech/编译：微科盟-草重木雪，编辑：微科盟Emma、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载。导读苓桂术甘汤（LGZGD）是一种经典的中药方剂。我们之前的研究发现，LGZGD可以逆转心力衰竭（HF）小鼠的脂质代谢紊乱。本研究旨在揭示LGZGD的脂质代谢调节。我们通过腹腔注射阿霉素建立小鼠心衰模型；用超高效液相四级杆飞行时间质谱（UHPLC-QTOF-MS）方法鉴定LGZGD的成分；通过血清脂质组学和心脏组织蛋白质组学检测LGZGD对脂质代谢的调节；进一步进行分子对接以筛选活性成分。我们共鉴定出78种LGZGD化合物。脂质组学结果显示，在LGZGD处理后，37种脂质表现出明显的恢复趋势。蛋白质组学结果表明，在HF小鼠中，服用LGZGD可改变55种蛋白质。经过富集分析，Apelin通路上的Prakg2/Ucp2/Plin1轴在LGZGD治疗HF中起着至关重要的作用。9种活性成分表现出与apelin受体结合的优异能力，MM-GBSA值低于−60

CP的基因组学研究下一代测序（NGS），包括全基因组测序（WGS）和全外显子组测序（WES），可以识别导致家族性或偶发性CP病例的遗传因素，包括单核苷酸变异（SNV）、拷贝数变异（CNV）。2.1

JournalIF：7.091发表时间：2022.12通讯作者：张绍铃&陶书田通讯作者单位：南京农业大学实验设计实验结果1.

ProductsIF：6.449发表时间：2022年4月通讯作者：高飞，周宜君通讯作者单位：中央民族大学生命与环境科学学院DOI号：10.1016/j.indcrop.2022.114946实验设计

临床相关亚克隆个性化医疗的一个悬而未决的问题是如何处理可被抗肿瘤治疗靶向的亚克隆驱动突变。通过整合额外的空间数据层，可以建立空间背景，从而建立亚克隆改变的临床相关性43,208（图

ProteomEx工作流程开发和优化为了进行生物组织的空间分辨蛋白质组学，我们采用改良的蛋白质保留的膨胀显微镜（ExM，expansion

qRT-PCR分析PdBRI1在各种组织中的表达。叶、芽、根、上部茎（第5茎节间）、中茎（第15茎节间）和基茎（第30茎节间）从1米高的杨树植物中取样。数据表示为三个生物学重复的平均值±标准差。

%。在这两个图中，样品分为两个不同的集群，4℃和30℃储存的大蒜和它们的生物复制品集合有显著的区别，这表明在不同温度下储存的大蒜在基因和蛋白质水平上都有显著的差异，从而导致收获后大蒜的生理代谢差异。

（A）通过SDS-PAGE（蓝色染色）分离组织EV蛋白，其中EV是通过kit-TiO2方法分离的；（B）组织EVs蛋白和肝组织蛋白（LHC：肝匀浆胶原酶）的SDS-PAGE分布（每条泳道加载20

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36439692/----------微科盟更多推荐----------

蛋白提取后，采用TMT标记。研究者通过LC-MS/MS检测和文库检索，共获得420674个二级光谱和82707个有效光谱，鉴定出45310个多肽和6856个蛋白质。根据Score

disease译名：循环血浆外泌体的蛋白质组学分析揭示了阿尔茨海默病的新型生物标志物期刊：Alzheimers

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0147651321012616----------微科盟更多推荐----------

https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2022.11.187----------微科盟更多推荐----------

一项大规模的荟萃分析表明，参与抗原加工的基因网络与CAD密切相关。该网络的关键驱动因素包括GLO1，它加强了该蛋白在重编程动脉粥样硬化斑块微环境中的潜在作用。我们还观察到碳酸酐酶

HCO组与LCO组在平菇中差异表达蛋白的火山图红点表示LCO组中上调的蛋白质。蓝点表示HCO组中上调的蛋白质。灰点表示没有显著差异表达的蛋白质。差异表达蛋白质的阈值是倍数变化超过1.5倍且FDR

CTMs中具有高基因显著值的ctmTF的表达模式和调控网络，基于热图中每个细胞的z评分拷贝数，对所有亚群中每个蛋白质表达的值进行颜色编码。红色节点指示ctmTF，蓝色节点指示网络中的相关TG；c,

2.0.3.0版本对蛋白质数据库进行再次检索，并将检索结果导入到SpectronautTM15.2版本中生成HCC谱库。HCC谱库可用于SpectronautTM15.2版本和DIA-

T2基因的转录表达受到低温、高盐胁迫和缺氧胁迫等非生物胁迫的影响，也受到植物衰老、缺磷和损伤的诱导。此外，根提取物中丰富的蛋白质还包括组蛋白H2B，但与脱水蛋白和RNase

T细胞的位置与APOE+巨噬细胞呈正相关，APOE+细胞也表达PD-L1和PD-L2，表明其具有积极的免疫调节作用。在侵袭性肿瘤部分也检测到表达cxcl10的巨噬细胞和CD8+

physiology译名：远交系褐色脂肪蛋白质组的结构定义了代谢生理学的调节因子期刊：CellIF：66.850发表时间：2022.11通讯作者：Edward

T细胞蛋白质组的抗原重组，以确定mTORC1的调控作用，最终共鉴定9000多种蛋白质，进而阐明了环境信号通路如何与抗原和细胞因子信号相结合，从而产生特异且适当的免疫应答。作者确定了CD4+和CD8+

BioinformaticsIF：13.994发表时间：2022.11通讯作者：朱峰通讯作者单位：浙江大学药学院实验设计主要内容1.

卵黄蛋白（IgY），蛋黄的颗粒状部分主要含有卵黄磷蛋白，如高密度的卵黄高磷蛋白和低密度的脱辅基蛋白。除了这些主要的蛋白以外，蛋黄中还含有很多的酶类、维生素结合蛋白、α2

1%的临床和技术变量作为混杂因素。研究表明，冷缺血时间(CIT)会影响磷蛋白组和其它潜在的蛋白质组，在重症监护室(ICU)的住院天数与蛋白质的差异性相关。通过同样的过程，选择所有样本的

spectra，按顺序窗口采集所有理论质谱）技术检测了晚疫病菌PAMP诱导后的本氏烟草叶片的蛋白质组变化，该技术提供了蛋白质丰度的定量和PTI相关蛋白质的大规模鉴定。总共鉴定到4401个蛋白，与0

脂质组学表明，预防NASH的有效性与肝脂质组学分析显示的甘油三酯、二酰甘油和神经酰胺水平的降低密切相关；3.

spectrometry译名：利用基于液相色谱-质谱的多信息融合技术，通过Notch信号通路和结构分析，探索人参糖蛋白改善小鼠学习记忆的潜力期刊：Journal

Microbiol：iTRAQ蛋白质组学分析揭示耐辐射奇球菌对12C6+重离子辐照的响应综述（IF:13.068）|J

Gy时存在过度杀伤效应，且高LET时呈现出RBE的下降。上述研究结果表明，耐辐射奇球菌对重离子辐照具有极强的抗性，这与之前的研究报道数据相一致。图1

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9264278/----------微科盟更多推荐----------

mRNA的表达。颜色强度表示表达水平，圆点大小表示表达CTSD的细胞百分比。B、LDs和DKD患者近端小管细胞簇的CTSD平均表达水平。DTL：亨利袢降支细段；LD：活体供者；PT：近端小管。4.

succession译名：浮游植物演替反映了中生代海水中金属有效性的下降期刊：Nature

编译微文：将英文文献编译成微文（注：通过自己的理解，整理干货内容，编译成微文）。形式：长篇解读。可点击下方链接参考往期微文。长篇解读微文（例）：科研