其他
Science:David Baker从头设计二十面体衣壳蛋白,可作为疫苗载体
▎Armstrong
2023年4月20日,Science期刊发表了David Baker团队的最新文章,通过强化学习实现自上而下的蛋白骨架设计。
自然进化的蛋白,通常可以实现多个亚基组装成复杂的结构以实现特定功能,而目前的从头设计方法往往做不到。本文研究中,David Baker团队建立了一种基于蒙特卡洛树的自上而下的强化学习蛋白设计方法,可以实现从头设计这样的复杂蛋白。
与自下而上的蛋白设计方式完全不同,自上而下的方式可以通过定义目标骨架的结构来定向得到这样的蛋白。
下图描述了利用蒙特卡洛树搜索(MCTS)方法设计盘状纳米孔蛋白的过程。
研究团队还用这种方法设计了二十面体结构如衣壳蛋白。
的这些从头设计的衣壳蛋白可以有多种用途,例如作为疫苗载体,研究团队进行了体内研究,验证了这种方法的可行性。
总结
技术的快速发展让原本高度复杂的蛋白质结构,变得可以分析、可以预测、甚至可以从头设计。从头设计的治疗性蛋白往往受制于免疫原性问题,走向临床应用需要非常慎重。但对于疫苗载体来说,常用的AAV载体等同样存在很强的预存抗体问题,需要复杂的改造,从头设计的载体或许提供了另外一种解决方案。
Armstrong技术全梳理系列
和铂医药技术全梳理; 荣昌生物技术全梳理; 再鼎医药技术全梳理; 药明生物技术全梳理; 恒瑞医药技术全梳理; 豪森药业技术全梳理; 正大天晴技术全梳理; 吉凯基因技术全梳理; 基石药业技术全梳理; 百济神州技术全梳理; 百济神州技术全梳理第2版; 信达生物技术全梳理; 信达生物技术全梳理第2版; 中山康方技术全梳理; 复宏汉霖技术全梳理; 先声药业技术全梳理; 君实生物技术全梳理; 嘉和生物技术全梳理; 志道生物技术全梳理; 道尔生物技术全梳理; 尚健生物技术全梳理; 康宁杰瑞技术全梳理; 科望医药技术全梳理; 科望医药技术全梳理2.0; 岸迈生物技术全梳理; 礼进生物技术全梳理; 康桥资本技术全梳理; 余国良的抗体药布局; 荃信生物技术全梳理; 安源医药技术全梳理; 三生国健技术全梳理; 仁会生物技术全梳理; 乐普生物技术全梳理; 同润生物技术全梳理; 宜明昂科技术全梳理; 派格生物技术全梳理; 迈威生物技术全梳理; Momenta技术全梳理; NGM技术全梳理; 普米斯生物技术全梳理; 普米斯生物技术全梳理2.0; 三叶草生物技术全梳理; 泽璟制药抗体药全梳理; 恒瑞医药抗体药全梳理; 齐鲁制药抗体药全梳理; 石药集团抗体药全梳理; 豪森药业抗体药全梳理; 华海药业抗体药全梳理; 科伦药业抗体药全梳理; 百奥泰技术全梳理; 凡恩世技术全梳理。